64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2792 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  100 
 
 		 192 aa  396  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  86.77 
 
 		 189 aa  339  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  86.98 
 
 		 193 aa  338  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  86.98 
 
 		 193 aa  338  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  85.19 
 
 		 189 aa  334  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  86.91 
 
 		 193 aa  314  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  82.94 
 
 		 293 aa  261  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  65.36 
 
 		 191 aa  252  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  62.89 
 
 		 194 aa  251  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  64.8 
 
 		 191 aa  250  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  64.8 
 
 		 194 aa  249  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  64.25 
 
 		 194 aa  249  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  64.25 
 
 		 194 aa  248  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  64.8 
 
 		 191 aa  248  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  64.8 
 
 		 191 aa  248  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  64.25 
 
 		 193 aa  246  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  57.67 
 
 		 190 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  60.89 
 
 		 202 aa  232  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  87.83 
 
 		 442 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  60.77 
 
 		 247 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  56.93 
 
 		 138 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  93.55 
 
 		 78 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  36.11 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  35.91 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  32.78 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  34.62 
 
 		 200 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  32.97 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1181  phage tail assembly protein  57.95 
 
 		 212 aa  99  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128725  normal  0.507373 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  31.67 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  32.97 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  33.52 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  33.15 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  36.23 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  36.23 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  32.97 
 
 		 200 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  28.04 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  30.85 
 
 		 197 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  31.36 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  35.94 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2197  hypothetical protein  31.67 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.107741  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  30.96 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  45.45 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  51.56 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  44.19 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  55.56 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  55 
 
 		 89 aa  60.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  54.1 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  46.51 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  60.42 
 
 		 89 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  60.42 
 
 		 82 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  53.23 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  45.35 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  50 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3934  tail fiber assembly domain protein  48.44 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329117  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1861  bacteriophage-acquired protein  31.55 
 
 		 253 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  35.4 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2808  tail assembly chaperone gp38  28.87 
 
 		 139 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1920  putative tail fiber assembly-like protein  28.57 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4854  tail assembly chaperone gp38  31.21 
 
 		 292 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  46.3 
 
 		 142 aa  45.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  30.33 
 
 		 138 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0684  tail fiber assembly protein  36.36 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5072  tail fiber assembly protein  36.36 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2241  phage tail assembly protein  63.89 
 
 		 47 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.206119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>