53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2917 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  100 
 
 		 184 aa  377  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  67.27 
 
 		 191 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  58.73 
 
 		 189 aa  197  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  53.64 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  57.33 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1040  hypothetical protein  45.1 
 
 		 177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  42.08 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  64.42 
 
 		 135 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  37.64 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1452  hypothetical protein  37.95 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000363258  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  36.76 
 
 		 171 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2782  putative phage tail fiber assembly protein  35 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120989  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3473  putative phage tail fiber assembly protein  35 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00673072  hitchhiker  0.00000114325 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1013  tail fiber assembly protein  29.56 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2595  tail fiber assembly protein  29.81 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0929  tail assembly chaperone gp38  27.38 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  58.06 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  58.06 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  53.23 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  54.84 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3032  putative phage tail fiber assembly protein  32.02 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0711  putative bacteriophage tail protein  25.99 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.664005  normal  0.0192003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2849  putative phage tail fiber assembly protein  31.46 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  57.14 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2472  putative phage tail fiber assembly protein  31.37 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380521 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1179  tail fibre assembly protein  27.12 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.376111  normal  0.114293 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  47.44 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  49.23 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  53.23 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  57.14 
 
 		 442 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  44.62 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  44.62 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  44.62 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  44.62 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  46.27 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  47.37 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  52.63 
 
 		 89 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  46.15 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  49.09 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  46.15 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  46.05 
 
 		 138 aa  52  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  43.94 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  53.57 
 
 		 78 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  40.62 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  51.79 
 
 		 293 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  50.91 
 
 		 88 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  40.91 
 
 		 205 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  50.91 
 
 		 89 aa  48.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  52.27 
 
 		 82 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  44.78 
 
 		 198 aa  44.7  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0627  hypothetical protein  40.62 
 
 		 116 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  42.42 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  29.26 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>