31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0627 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0627  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  237  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  37.1 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  31.2 
 
 		 208 aa  47.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  43.1 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  39.34 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  37.5 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  39.06 
 
 		 194 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  37.5 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  33.02 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  38.46 
 
 		 193 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  37.5 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  37.5 
 
 		 247 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  37.5 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  40 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  36.92 
 
 		 138 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  32.38 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  41.67 
 
 		 89 aa  43.5  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  35.94 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  32.38 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  40.62 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  35.94 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  37.5 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  41.27 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  42.37 
 
 		 89 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  39.68 
 
 		 189 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  42.37 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  41.67 
 
 		 175 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  36.11 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  34.33 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  40.68 
 
 		 193 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 		 198 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>