46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4484 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  100 
 
 		 135 aa  276  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  64.42 
 
 		 184 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  79.73 
 
 		 191 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  78.38 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  70.27 
 
 		 175 aa  104  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  62.5 
 
 		 175 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  59.68 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  59.68 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  58.06 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  57.63 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  53.23 
 
 		 189 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  55.56 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  44.59 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  45.95 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  48.53 
 
 		 247 aa  57  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  51.52 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1052  phage tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  40.26 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  56.14 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  61.7 
 
 		 442 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  46.97 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  47.06 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  50 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  47.06 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  47.14 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  46.97 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  52.54 
 
 		 293 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  46.97 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  46.97 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  48.48 
 
 		 194 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  48.48 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  60.42 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2760  tail assembly chaperone gp38  34.62 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000085866 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2808  tail assembly chaperone gp38  35.59 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  58 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  50.88 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  40.62 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  36.36 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  62.16 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  39.08 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0627  hypothetical protein  32.38 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  44.44 
 
 		 209 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2241  phage tail assembly protein  51.28 
 
 		 47 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.206119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  32.86 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  41.54 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4023  tail assembly chaperone gp38  32.61 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>