53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2245 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  100 
 
 
191 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  94.15 
 
 
189 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  67.27 
 
 
184 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  43.1 
 
 
175 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  46.91 
 
 
175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  40.11 
 
 
184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  79.73 
 
 
135 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  35.19 
 
 
170 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1452  hypothetical protein  34.23 
 
 
179 aa  87  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000363258  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  34.36 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1040  hypothetical protein  32.02 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2782  putative phage tail fiber assembly protein  32.29 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120989  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3473  putative phage tail fiber assembly protein  32.29 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00673072  hitchhiker  0.00000114325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3032  putative phage tail fiber assembly protein  31.22 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250223 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  30.96 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0929  tail assembly chaperone gp38  27.13 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  56.45 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  56.45 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  38.79 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2849  putative phage tail fiber assembly protein  30.69 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  43.88 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  55.36 
 
 
193 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  43.75 
 
 
194 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2472  putative phage tail fiber assembly protein  30.91 
 
 
175 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00380521 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  40.62 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  40.62 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  43.75 
 
 
247 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  42.71 
 
 
194 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  42.71 
 
 
138 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  40.62 
 
 
191 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  40.62 
 
 
191 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  46.51 
 
 
192 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  41.67 
 
 
194 aa  57  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  41.67 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  57.14 
 
 
442 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  54.39 
 
 
89 aa  55.1  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0711  putative bacteriophage tail protein  27.71 
 
 
172 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.664005  normal  0.0192003 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1013  tail fiber assembly protein  26.79 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  44.44 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2595  tail fiber assembly protein  27.65 
 
 
180 aa  52  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  53.57 
 
 
78 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1179  tail fibre assembly protein  28.92 
 
 
175 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.376111  normal  0.114293 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  51.79 
 
 
293 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  35.42 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  52.73 
 
 
88 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  52.73 
 
 
89 aa  49.7  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  42.42 
 
 
209 aa  48.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  40.91 
 
 
205 aa  47.8  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  54.55 
 
 
82 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  44.78 
 
 
198 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0627  hypothetical protein  33.02 
 
 
116 aa  44.7  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  35.96 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  38.6 
 
 
206 aa  41.6  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>