20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2595 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2595  tail fiber assembly protein  100 
 
 		 180 aa  370  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1013  tail fiber assembly protein  87.78 
 
 		 181 aa  334  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1040  hypothetical protein  44.81 
 
 		 177 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  43.17 
 
 		 175 aa  144  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  39.56 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1452  hypothetical protein  38.22 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000363258  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0711  putative bacteriophage tail protein  33.7 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.664005  normal  0.0192003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1179  tail fibre assembly protein  34.25 
 
 		 175 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.376111  normal  0.114293 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  29.81 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3032  putative phage tail fiber assembly protein  30.34 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3473  putative phage tail fiber assembly protein  28.73 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00673072  hitchhiker  0.00000114325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2782  putative phage tail fiber assembly protein  28.73 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120989  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2472  putative phage tail fiber assembly protein  29.55 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380521 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  25.4 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2849  putative phage tail fiber assembly protein  29.78 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0929  tail assembly chaperone gp38  25.61 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  27.65 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4023  tail assembly chaperone gp38  31.58 
 
 		 131 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  26.95 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  31.75 
 
 		 198 aa  45.1  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>