23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1179 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1179  tail fibre assembly protein  100 
 
 		 175 aa  360  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.376111  normal  0.114293 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0711  putative bacteriophage tail protein  86.05 
 
 		 172 aa  311  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.664005  normal  0.0192003 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1452  hypothetical protein  40.11 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000363258  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  38.07 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  33.71 
 
 		 171 aa  98.2  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1013  tail fiber assembly protein  31.69 
 
 		 181 aa  87.8  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2595  tail fiber assembly protein  34.25 
 
 		 180 aa  87.8  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1040  hypothetical protein  30.36 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0929  tail assembly chaperone gp38  28.66 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  29.19 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  27.72 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  44.74 
 
 		 198 aa  60.8  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2782  putative phage tail fiber assembly protein  30.41 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120989  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3473  putative phage tail fiber assembly protein  30.41 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00673072  hitchhiker  0.00000114325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  27.12 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  28.04 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4023  tail assembly chaperone gp38  27.41 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  28.92 
 
 		 191 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2849  putative phage tail fiber assembly protein  28.65 
 
 		 175 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3032  putative phage tail fiber assembly protein  28.65 
 
 		 175 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  26.95 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2472  putative phage tail fiber assembly protein  28 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380521 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1320  hypothetical protein  76 
 
 		 38 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.043806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>