44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2077 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  100 
 
 		 78 aa  154  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  91.03 
 
 		 192 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  97.44 
 
 		 293 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  94.87 
 
 		 442 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  73.33 
 
 		 189 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  71.05 
 
 		 193 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  71.05 
 
 		 193 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  65.33 
 
 		 189 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  81.33 
 
 		 193 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  57.14 
 
 		 247 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  63.08 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  56.25 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  58.67 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  55.84 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  55.84 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  57.33 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  61.54 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  61.54 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  61.54 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  61.54 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  53.97 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  51.56 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  47.95 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  55 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  52.54 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  54.1 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  53.03 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  54.84 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  60.42 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  48.39 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  40.74 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3934  tail fiber assembly domain protein  52.54 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329117  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  51.61 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  51.61 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  48.33 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  50 
 
 		 189 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  47.37 
 
 		 206 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  41.94 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  44.62 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  41.89 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  44.44 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2808  tail assembly chaperone gp38  48.84 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  40.38 
 
 		 209 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2241  phage tail assembly protein  61.11 
 
 		 47 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.206119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>