36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3934 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3934  tail fiber assembly domain protein  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  48.28 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  48.44 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  46.55 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  44.07 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  44.07 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  44.83 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  44.83 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  46.55 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  48.28 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  46.55 
 
 		 247 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  60.47 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  58.14 
 
 		 293 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  42.68 
 
 		 189 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2768  tail fiber assembly domain-containing protein  33.66 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0680502  normal  0.0215705 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  41.86 
 
 		 193 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  41.86 
 
 		 193 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  49.18 
 
 		 193 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  39.51 
 
 		 189 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  58.14 
 
 		 442 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  44.07 
 
 		 194 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  44.07 
 
 		 194 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  52 
 
 		 188 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  42.11 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  41.54 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  42.19 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  41.54 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1136  hypothetical protein  45.1 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  41.54 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  46.94 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  49.02 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  44.83 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2808  tail assembly chaperone gp38  38.1 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  44.26 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  37.18 
 
 		 202 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  36.11 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>