37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2241 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2241  phage tail assembly protein  100 
 
 
47 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.206119 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  75 
 
 
193 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  76.32 
 
 
189 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  68.42 
 
 
193 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  68.42 
 
 
193 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  63.16 
 
 
193 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  60.53 
 
 
89 aa  55.1  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  62.16 
 
 
247 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  62.16 
 
 
194 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  62.16 
 
 
194 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  62.16 
 
 
191 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  59.46 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  62.16 
 
 
191 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  62.16 
 
 
191 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  59.46 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  62.16 
 
 
191 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  62.16 
 
 
194 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01356  hypothetical protein  63.89 
 
 
36 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  65.79 
 
 
189 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  56.76 
 
 
194 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  56.41 
 
 
170 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  48.72 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  65.71 
 
 
202 aa  47.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  55.26 
 
 
204 aa  47.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  51.28 
 
 
175 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  52.63 
 
 
203 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1636  tail fiber assembly protein, truncation  71.43 
 
 
30 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269715  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  50 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  50 
 
 
184 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  57.14 
 
 
190 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  63.89 
 
 
442 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  51.28 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  60 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  63.89 
 
 
192 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  50 
 
 
184 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  61.11 
 
 
293 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  43.59 
 
 
175 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>