27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01356 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_01356  hypothetical protein  100 
 
 
36 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  97.22 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  97.22 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  97.22 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  97.22 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  91.67 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  91.67 
 
 
247 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  88.89 
 
 
194 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  91.67 
 
 
194 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  91.67 
 
 
194 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  86.11 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  88.89 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  88.89 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  86.11 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1636  tail fiber assembly protein, truncation  100 
 
 
30 aa  62  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269715  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  75 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2241  phage tail assembly protein  63.89 
 
 
47 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.206119 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  62.86 
 
 
190 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  71.43 
 
 
202 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  85.71 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  61.11 
 
 
203 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  58.33 
 
 
171 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  61.11 
 
 
204 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  61.11 
 
 
184 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  58.33 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  58.33 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  55.56 
 
 
208 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>