66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1816 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 
203 aa  414  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  67.49 
 
 
204 aa  285  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  50 
 
 
206 aa  195  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  46.04 
 
 
209 aa  182  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  45.88 
 
 
205 aa  180  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  44.9 
 
 
206 aa  176  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  44.85 
 
 
208 aa  174  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  38.54 
 
 
198 aa  147  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  36.55 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  36.04 
 
 
200 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  37.78 
 
 
193 aa  138  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  36.79 
 
 
200 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  37.22 
 
 
194 aa  135  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  37.22 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  37.22 
 
 
191 aa  132  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  37.22 
 
 
191 aa  132  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  36.27 
 
 
200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  36.27 
 
 
200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  36.67 
 
 
194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  36.67 
 
 
194 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  34.08 
 
 
190 aa  131  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  36.11 
 
 
191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  36.11 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  35.75 
 
 
202 aa  126  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  34.04 
 
 
189 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  34.25 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  33.88 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  33.88 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  33.15 
 
 
192 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  39.29 
 
 
247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2197  hypothetical protein  30.49 
 
 
218 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.107741  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  33.88 
 
 
193 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  34.81 
 
 
138 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  30.57 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  33.07 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  32.14 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  30.77 
 
 
293 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  54.72 
 
 
184 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  48.21 
 
 
89 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  28.43 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  47.37 
 
 
88 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  47.37 
 
 
89 aa  55.5  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1332  tail fiber assembly protein from lambdoid prophage e14  26.84 
 
 
223 aa  51.6  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1305  tail assembly chaperone gp38  31.18 
 
 
114 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.059045  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 
170 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2371  putative phage tail fiber assembly protein  32.22 
 
 
139 aa  49.7  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.786543  normal  0.362441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 
138 aa  48.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01356  hypothetical protein  61.11 
 
 
36 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  39.68 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  39.68 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4854  tail assembly chaperone gp38  26.58 
 
 
292 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  35.71 
 
 
171 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  37.5 
 
 
135 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  38.1 
 
 
189 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3110  tail assembly chaperone gp38  34.67 
 
 
145 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130843  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1861  bacteriophage-acquired protein  31.75 
 
 
253 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  34.92 
 
 
184 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  34.48 
 
 
442 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2241  phage tail assembly protein  52.63 
 
 
47 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.206119 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1920  putative tail fiber assembly-like protein  32.64 
 
 
250 aa  45.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1052  phage tail assembly chaperone gp38  38.1 
 
 
140 aa  45.1  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0182  hypothetical protein  34.67 
 
 
145 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1181  phage tail assembly protein  31.82 
 
 
212 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128725  normal  0.507373 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  33.33 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0627  hypothetical protein  32.76 
 
 
116 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  34.85 
 
 
142 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>