45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3110 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3110  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 		 145 aa  290  6e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0182  hypothetical protein  95.17 
 
 		 145 aa  275  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  83.33 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2371  putative phage tail fiber assembly protein  76.19 
 
 		 139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.786543  normal  0.362441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  47.59 
 
 		 142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2808  tail assembly chaperone gp38  38.26 
 
 		 139 aa  90.1  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2346  hypothetical protein  54.55 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1304  tail assembly chaperone gp38  35.33 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230331  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1052  phage tail assembly chaperone gp38  33.77 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0820  phage tail assembly chaperone gp38  32.65 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0692  hypothetical protein  34.38 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  39.13 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  35.62 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  35.8 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  40.3 
 
 		 198 aa  50.8  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  34.72 
 
 		 194 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2471  tail fiber assembly protein  30 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134956 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00852  hypothetical protein  31.37 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00846  conserved hypothetical protein  31.37 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  34.72 
 
 		 247 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  34.72 
 
 		 194 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  34.72 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  34.29 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  31.94 
 
 		 194 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2490  tail assembly chaperone gp38  41.98 
 
 		 210 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0688487  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  38.57 
 
 		 184 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  30.43 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  38.03 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4023  tail assembly chaperone gp38  35.82 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0299  tail fiber assembly protein  27.59 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.728872 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  33.33 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  38.36 
 
 		 193 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  38.36 
 
 		 193 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  38.18 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3033  tail fiber assembly protein  26.9 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000648798 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0941  putative tail fiber assembly protein  36.76 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  35.62 
 
 		 189 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  36.36 
 
 		 89 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2760  tail assembly chaperone gp38  26.17 
 
 		 139 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000085866 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 		 208 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>