49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2759 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 		 200 aa  410  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  97.5 
 
 		 200 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  88.5 
 
 		 200 aa  367  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  86 
 
 		 200 aa  355  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  86 
 
 		 200 aa  355  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  65.1 
 
 		 197 aa  230  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  49.25 
 
 		 198 aa  197  6e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1305  tail assembly chaperone gp38  86.24 
 
 		 114 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.059045  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  39.18 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  40.91 
 
 		 209 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  40.59 
 
 		 205 aa  137  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2197  hypothetical protein  43.03 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.107741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  36.36 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  36.04 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  35.98 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  34.24 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  32.62 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0941  putative tail fiber assembly protein  71.62 
 
 		 137 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  33.88 
 
 		 194 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  36.11 
 
 		 202 aa  104  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  33.88 
 
 		 194 aa  104  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  33.16 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  33.16 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  34.43 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  34.43 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 		 191 aa  101  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  34.55 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  32.8 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  34.55 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  33.52 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  31.75 
 
 		 189 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  32.75 
 
 		 247 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  32.61 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  33.08 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0820  phage tail assembly chaperone gp38  41.46 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1181  phage tail assembly protein  41.18 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128725  normal  0.507373 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  29.22 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4854  tail assembly chaperone gp38  29.38 
 
 		 292 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1304  tail assembly chaperone gp38  37.5 
 
 		 146 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0299  tail fiber assembly protein  37.5 
 
 		 147 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.728872 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00852  hypothetical protein  32.5 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00846  conserved hypothetical protein  32.5 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3033  tail fiber assembly protein  34.72 
 
 		 147 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000648798 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2490  tail assembly chaperone gp38  25.31 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0688487  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1861  bacteriophage-acquired protein  27.41 
 
 		 253 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  29.52 
 
 		 138 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1332  tail fiber assembly protein from lambdoid prophage e14  27.13 
 
 		 223 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>