21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1636 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A1636  tail fiber assembly protein, truncation  100 
 
 		 30 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01356  hypothetical protein  100 
 
 		 36 aa  62  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  100 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  89.66 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  89.66 
 
 		 194 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  89.66 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  89.66 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  89.66 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  89.66 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  89.66 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  82.76 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  86.21 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  72.41 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2241  phage tail assembly protein  71.43 
 
 		 47 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.206119 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  77.78 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  60.71 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  60.71 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  64.29 
 
 		 203 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>