23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5072 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0684  tail fiber assembly protein  100 
 
 		 236 aa  480  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5072  tail fiber assembly protein  100 
 
 		 236 aa  480  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6176  putative tail fiber assembly protein  58.18 
 
 		 64 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122746  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1920  putative tail fiber assembly-like protein  36.61 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3307  hypothetical protein  50.79 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.23769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2683  hypothetical protein  35.53 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  32.35 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1861  bacteriophage-acquired protein  35.92 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  38.75 
 
 		 191 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  37.5 
 
 		 191 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  37.5 
 
 		 191 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  38.75 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  37.5 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  33.66 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  37.5 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0746  hypothetical protein  46.81 
 
 		 168 aa  46.6  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.0869427 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  34.65 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  36.25 
 
 		 189 aa  45.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  36.25 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  37.04 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  35 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  36.36 
 
 		 192 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4854  tail assembly chaperone gp38  27.13 
 
 		 292 aa  42  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>