32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6708 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6708  Appr-1-p processing domain protein  100 
 
 		 199 aa  416  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3377  Appr-1-p processing domain protein  40.5 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.590192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0008  appr-1-p processing domain-containing protein  45.69 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00352101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0143  appr-1-p processing domain-containing protein  41.21 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1996  appr-1-p processing domain-containing protein  36.9 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01180  predicted phosphatase, C-terminal domain of histone macro H2A1 like protein  33.88 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.994546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2793  appr-1-p processing enzyme family protein  35.93 
 
 		 274 aa  98.2  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0273  phosphatase like to the domain of histone macroH2A1  32.75 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  38.14 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0099  Appr-1-p processing domain protein  28.25 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.310207  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0560  Appr-1-p processing domain protein  28.66 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4137  Appr-1-p processing domain-containing protein  23.6 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0695  Appr-1-p processing domain protein  31.21 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.701989  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06361  conserved hypothetical protein  27.66 
 
 		 249 aa  51.2  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.84373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1160  appr-1-p processing domain-containing protein  29.2 
 
 		 167 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.429654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3357  Appr-1-p processing domain protein  31.65 
 
 		 162 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1293  hypothetical protein  29.85 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0201116 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1101  hypothetical protein  26.57 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  29.03 
 
 		 349 aa  45.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11928  lipoprotein lppD  28.82 
 
 		 358 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0395522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  28.36 
 
 		 341 aa  44.7  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3196  Appr-1-p processing domain protein  34.62 
 
 		 165 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0206  hypothetical protein  27.74 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  32.26 
 
 		 166 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  29.88 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2286  hypothetical protein  32.82 
 
 		 177 aa  42  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0694  hypothetical protein  29.1 
 
 		 179 aa  42  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000693034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2200  hypothetical protein  28.57 
 
 		 304 aa  41.6  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.882986  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3249  Appr-1-p processing domain protein  36.99 
 
 		 197 aa  41.6  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1243  hypothetical protein  27.94 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.188062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  40.28 
 
 		 177 aa  41.2  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0257  hypothetical protein  27.92 
 
 		 196 aa  41.2  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.588012  normal  0.197055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>