131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5676 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5676  tail collar domain-containing protein  100 
 
 		 414 aa  833    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.204656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1283  phage-related tail fiber protein  34.06 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1013  tail collar domain-containing protein  33.09 
 
 		 387 aa  106  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1250  tail collar domain-containing protein  32.37 
 
 		 414 aa  106  9e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  28.38 
 
 		 323 aa  98.6  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5767  putative phage tail Collar domain  31.91 
 
 		 300 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  33.09 
 
 		 501 aa  86.7  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0519  Tail Collar domain protein  31.06 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  43 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2442  Tail Collar domain protein  40 
 
 		 282 aa  75.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2573  Tail Collar domain protein  46.23 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  35.87 
 
 		 654 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  35.87 
 
 		 654 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  41.54 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  43.43 
 
 		 172 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3075  putative phage tail collar domain  28.06 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.242473  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  41 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  55.88 
 
 		 554 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  40.38 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  38.61 
 
 		 180 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  38 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  37.14 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  36.7 
 
 		 199 aa  67  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  44.32 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  35.51 
 
 		 199 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  38.46 
 
 		 173 aa  66.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  41.58 
 
 		 173 aa  66.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  33.33 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  35.51 
 
 		 199 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  35.51 
 
 		 199 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  37.62 
 
 		 171 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  40.2 
 
 		 179 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  33.33 
 
 		 175 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5675  hypothetical protein  33.59 
 
 		 1065 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  38.38 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  36.36 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  39 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  33.59 
 
 		 492 aa  63.2  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  42.27 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  39.22 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  38.68 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  35.29 
 
 		 195 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  36.27 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  37.37 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  38.61 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  35.51 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  37.5 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  34 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  34 
 
 		 176 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  32.71 
 
 		 166 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  37.23 
 
 		 163 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  36.17 
 
 		 157 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  26.85 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  35.62 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  35 
 
 		 181 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  31.25 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  34.38 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  36.27 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  39.18 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  35 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  35 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  38 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  34.95 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  37 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  33.33 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  36.56 
 
 		 169 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  36 
 
 		 172 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  34.69 
 
 		 171 aa  57  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  35.56 
 
 		 173 aa  57  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  37.63 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  36.08 
 
 		 183 aa  55.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  43.86 
 
 		 211 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  38.38 
 
 		 166 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  33.57 
 
 		 172 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  35.23 
 
 		 171 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  33 
 
 		 181 aa  54.3  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  37 
 
 		 186 aa  54.3  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  30.3 
 
 		 183 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  35.79 
 
 		 203 aa  54.3  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0391  Tail Collar domain protein  35.04 
 
 		 304 aa  54.3  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  36.36 
 
 		 173 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  33.66 
 
 		 173 aa  53.9  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  34.02 
 
 		 176 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  34.34 
 
 		 184 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  26.57 
 
 		 320 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  34.86 
 
 		 199 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  29.58 
 
 		 790 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1990  tail collar domain-containing protein  27.27 
 
 		 865 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  32.04 
 
 		 179 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  48.21 
 
 		 167 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  26.22 
 
 		 1120 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1749  Tail Collar domain protein  45.33 
 
 		 261 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  31.58 
 
 		 175 aa  51.2  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  50 
 
 		 204 aa  50.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  30.77 
 
 		 163 aa  50.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  34.34 
 
 		 183 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  29.8 
 
 		 197 aa  50.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0486  Tail Collar domain protein  47.27 
 
 		 87 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  26.77 
 
 		 1137 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>