140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1337 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  100 
 
 		 171 aa  348  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  57.99 
 
 		 170 aa  203  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  57.22 
 
 		 179 aa  201  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  53.71 
 
 		 170 aa  194  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  55.21 
 
 		 163 aa  190  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  55.56 
 
 		 172 aa  189  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  49.12 
 
 		 172 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  52.94 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  53.7 
 
 		 157 aa  175  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  46.55 
 
 		 174 aa  171  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  47.49 
 
 		 175 aa  167  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  48.84 
 
 		 176 aa  165  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  51.72 
 
 		 165 aa  163  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  47.4 
 
 		 169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  47.98 
 
 		 171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  46.11 
 
 		 181 aa  160  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  48.86 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  47.67 
 
 		 173 aa  158  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  46.2 
 
 		 163 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  44.21 
 
 		 192 aa  156  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  42.61 
 
 		 176 aa  156  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  44.07 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  44.97 
 
 		 189 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  44.97 
 
 		 189 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  45.98 
 
 		 173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  43.09 
 
 		 182 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  45.71 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  44.91 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  45.35 
 
 		 173 aa  150  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  47.4 
 
 		 173 aa  150  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  44.25 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  45.4 
 
 		 175 aa  148  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  45.95 
 
 		 181 aa  147  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  42.05 
 
 		 177 aa  144  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  44.38 
 
 		 195 aa  144  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  41.21 
 
 		 178 aa  144  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  45.16 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  39.66 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  43.58 
 
 		 181 aa  141  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  40.2 
 
 		 199 aa  141  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  43.79 
 
 		 199 aa  140  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  40.45 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  44.13 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  40.98 
 
 		 181 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  42.22 
 
 		 180 aa  138  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  47.43 
 
 		 173 aa  137  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  39.22 
 
 		 199 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  39.22 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  37.37 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  42.13 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  37.07 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  41.71 
 
 		 176 aa  134  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  38.86 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  42.11 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  43.43 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  41.14 
 
 		 176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  41.01 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  40.46 
 
 		 180 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  44.97 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  40.86 
 
 		 183 aa  130  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  45.61 
 
 		 167 aa  130  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  37.29 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  41.38 
 
 		 177 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  38.55 
 
 		 183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  39.9 
 
 		 195 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  42.01 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  38.12 
 
 		 183 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2454  phage tail Collar  40.59 
 
 		 165 aa  124  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.45663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  38.24 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  36 
 
 		 186 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03559  microcystin dependent protein  37.14 
 
 		 178 aa  119  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.536453  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1453  Phage tail Collar  36.84 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  36.53 
 
 		 199 aa  117  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  37.22 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03557  microcystin dependent protein  36.26 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  36.65 
 
 		 195 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4046  phage tail collar domain-containing protein  41.48 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  35.56 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  34.38 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  36.13 
 
 		 195 aa  107  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  34.13 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  53.61 
 
 		 211 aa  101  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4048  phage tail collar domain-containing protein  37.5 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  37.91 
 
 		 206 aa  99.4  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6119  Tail Collar domain protein  34.5 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  32.35 
 
 		 203 aa  98.2  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  32.8 
 
 		 184 aa  97.8  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  29.44 
 
 		 196 aa  97.8  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  34.87 
 
 		 210 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0053  phage tail collar domain-containing protein  28.64 
 
 		 209 aa  86.3  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  35.19 
 
 		 264 aa  85.5  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  29.7 
 
 		 204 aa  84.3  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4767  phage tail collar domain-containing protein  56.45 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.428551 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4722  phage tail collar domain-containing protein  55.74 
 
 		 80 aa  81.3  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  44.32 
 
 		 224 aa  80.9  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2124  Tail Collar domain protein  58.93 
 
 		 84 aa  80.9  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0481  Tail Collar domain protein  42.31 
 
 		 308 aa  74.3  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0471  Tail Collar domain protein  30.17 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0480  Tail Collar domain protein  41.82 
 
 		 310 aa  72  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2491  Tail Collar domain protein  52.54 
 
 		 80 aa  72  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>