122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2124 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2124  Tail Collar domain protein  100 
 
 
84 aa  172  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4767  phage tail collar domain-containing protein  59.52 
 
 
80 aa  97.8  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.428551 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4722  phage tail collar domain-containing protein  60.24 
 
 
80 aa  94  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0873  Tail Collar domain protein  55.68 
 
 
88 aa  93.2  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.379708  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  71.43 
 
 
175 aa  91.3  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  70.18 
 
 
181 aa  90.5  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  57.35 
 
 
169 aa  89  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  64.91 
 
 
195 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  67.86 
 
 
168 aa  88.2  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  66.07 
 
 
172 aa  87.4  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  63.16 
 
 
172 aa  87  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  64.91 
 
 
177 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  66.07 
 
 
176 aa  86.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  62.9 
 
 
173 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  62.5 
 
 
199 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  64.29 
 
 
199 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  62.5 
 
 
199 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  62.5 
 
 
199 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  66.07 
 
 
171 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  66.07 
 
 
173 aa  84.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  68.42 
 
 
172 aa  84.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  62.5 
 
 
174 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  66.07 
 
 
189 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  66.07 
 
 
189 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  67.86 
 
 
181 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  63.16 
 
 
180 aa  84.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  66.07 
 
 
211 aa  84  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  66.07 
 
 
175 aa  84  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  63.16 
 
 
173 aa  84  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  60.71 
 
 
178 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2491  Tail Collar domain protein  51.19 
 
 
80 aa  83.6  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  63.93 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  61.4 
 
 
179 aa  82  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  66.07 
 
 
165 aa  82  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  60.71 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  64.29 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2344  Tail Collar domain protein  46.99 
 
 
82 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  64.91 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  58.93 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  67.27 
 
 
195 aa  80.9  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  57.14 
 
 
205 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  64.29 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  60.71 
 
 
170 aa  80.5  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2887  Tail Collar domain protein  50.6 
 
 
80 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00705187  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  56.72 
 
 
173 aa  80.1  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  61.82 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  64.29 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  64.29 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  60.71 
 
 
173 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2885  Tail Collar domain protein  46.34 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000255968  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  56.72 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  56.36 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  59.65 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  63.16 
 
 
195 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  59.26 
 
 
182 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  59.65 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  60 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  62.5 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  53.57 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  61.4 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03559  microcystin dependent protein  58.93 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.536453  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0595  phage tail collar domain-containing protein  60.24 
 
 
80 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  58.93 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  58.93 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  57.89 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  57.14 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  60 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  53.03 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  54.39 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0486  Tail Collar domain protein  44.71 
 
 
87 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  57.14 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  55.36 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  56.14 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  50.72 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  64.58 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  60.42 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1453  Phage tail Collar  57.14 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  57.89 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  53.57 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0269  tail collar domain-containing protein  43.37 
 
 
78 aa  70.9  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0994346 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  57.14 
 
 
173 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  51.79 
 
 
203 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2493  Tail Collar domain protein  45.68 
 
 
81 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  51.79 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  52.73 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  54.39 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2343  Tail Collar domain protein  41.67 
 
 
80 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.607801 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  52.63 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  51.79 
 
 
204 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  52.31 
 
 
207 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0754  phage tail collar domain-containing protein  40.48 
 
 
80 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2492  Tail Collar domain protein  41.77 
 
 
84 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  51.79 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2884  Tail Collar domain protein  46.84 
 
 
81 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000266476  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  42.86 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0753  phage tail collar domain-containing protein  46.51 
 
 
82 aa  62.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0792659  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  55.56 
 
 
176 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2454  phage tail Collar  62.5 
 
 
165 aa  62  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.45663  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  53.57 
 
 
197 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2477  Collagen triple helix repeat protein  43.9 
 
 
207 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>