117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0471 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0471  Tail Collar domain protein  100 
 
 		 246 aa  485  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0566  Tail Collar domain protein  44.52 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0481  Tail Collar domain protein  51.59 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0391  Tail Collar domain protein  35.87 
 
 		 304 aa  141  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0480  Tail Collar domain protein  48.43 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  38.03 
 
 		 195 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  33.96 
 
 		 180 aa  106  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  34.72 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  33.18 
 
 		 178 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  34.11 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  37.26 
 
 		 195 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  37.26 
 
 		 196 aa  93.2  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  30.56 
 
 		 199 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  30.56 
 
 		 199 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  30.09 
 
 		 199 aa  89  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0053  phage tail collar domain-containing protein  32.24 
 
 		 209 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  41.12 
 
 		 181 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  32.39 
 
 		 189 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  31.97 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  45.36 
 
 		 177 aa  86.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  43.4 
 
 		 176 aa  85.9  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  32.08 
 
 		 189 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  36.51 
 
 		 195 aa  85.1  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  30.52 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  35.07 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  29.72 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  36.36 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  41.12 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  28.95 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  31.65 
 
 		 203 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  39.39 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  31.9 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  38.03 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  31.75 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  32.73 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  30.81 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  33.14 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  32.24 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  38.68 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  28.84 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  30.33 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  28.77 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  31.95 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1453  Phage tail Collar  30.84 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  29.32 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  27.62 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  40.21 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  28.04 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  32.09 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  26.76 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  38.14 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  36.08 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  30.17 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  27.03 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  27.36 
 
 		 169 aa  72  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  29.52 
 
 		 171 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  33.06 
 
 		 173 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03557  microcystin dependent protein  29.03 
 
 		 181 aa  71.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  37.76 
 
 		 172 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  38.14 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  34.29 
 
 		 174 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  36.94 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  31.12 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  40.38 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  33.33 
 
 		 157 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  33.14 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  35.29 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  37.5 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  38.1 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  36.45 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  28.5 
 
 		 175 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  26.54 
 
 		 171 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4046  phage tail collar domain-containing protein  29.05 
 
 		 179 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  40.23 
 
 		 175 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  33.01 
 
 		 207 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  24.41 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  26.29 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  34.69 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  26.5 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  28.37 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  30.45 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  27.83 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6119  Tail Collar domain protein  30.56 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03559  microcystin dependent protein  28.44 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.536453  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  37.63 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  27.49 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  28.37 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  27.31 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  30.95 
 
 		 166 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  32.65 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  31.96 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  27.98 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  34.56 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  26.61 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  32.67 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  41.56 
 
 		 554 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2454  phage tail Collar  30.48 
 
 		 165 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.45663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4048  phage tail collar domain-containing protein  26.89 
 
 		 179 aa  52  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5676  tail collar domain-containing protein  30.84 
 
 		 414 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.204656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2491  Tail Collar domain protein  42.86 
 
 		 80 aa  49.7  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>