113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0480 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0480  Tail Collar domain protein  100 
 
 		 310 aa  597  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0481  Tail Collar domain protein  85.81 
 
 		 308 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0391  Tail Collar domain protein  64.74 
 
 		 304 aa  368  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0471  Tail Collar domain protein  48.43 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0566  Tail Collar domain protein  44.59 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  39.84 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  43.9 
 
 		 205 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  45.28 
 
 		 173 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  34.81 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  33.33 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  41.41 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  40.74 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  41.41 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  41.27 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  36.67 
 
 		 176 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  34.03 
 
 		 203 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  39.84 
 
 		 199 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  36.59 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  38.26 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  44.71 
 
 		 176 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  36.72 
 
 		 176 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  41.82 
 
 		 171 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  35.12 
 
 		 172 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  37.96 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  40.37 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  36.11 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  38.89 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  36.89 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  36.7 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  32.86 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  40.19 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  34.78 
 
 		 179 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  35.94 
 
 		 172 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  33.58 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  36.11 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  35.85 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  36.11 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  31.3 
 
 		 170 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  44.32 
 
 		 207 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  39.62 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  34.06 
 
 		 198 aa  67  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  34.85 
 
 		 169 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  30.91 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  38.53 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  40.19 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  36.28 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  36.28 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  37.04 
 
 		 169 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  35.35 
 
 		 157 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  34.82 
 
 		 182 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03557  microcystin dependent protein  34.91 
 
 		 181 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  37.37 
 
 		 163 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  37.96 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  35.45 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  27.67 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  40.19 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  35.45 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  31.29 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  42.57 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  32.41 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1453  Phage tail Collar  36.69 
 
 		 187 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  33.64 
 
 		 176 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0053  phage tail collar domain-containing protein  36.79 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  32.11 
 
 		 163 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  29.1 
 
 		 175 aa  61.6  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  32.2 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  32.74 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  35.19 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  35.14 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  36.52 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  39.62 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  31.97 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  30.56 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  32.09 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  33.33 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  37.5 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  32.41 
 
 		 165 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  37.65 
 
 		 173 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  31.48 
 
 		 173 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03559  microcystin dependent protein  35.14 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.536453  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  40.91 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  34.26 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  33.96 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  30.56 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  33.86 
 
 		 173 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  35.58 
 
 		 167 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  35.48 
 
 		 186 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  38.46 
 
 		 204 aa  53.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  53.66 
 
 		 368 aa  52.8  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  30.84 
 
 		 176 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6119  Tail Collar domain protein  34.36 
 
 		 172 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  32.95 
 
 		 171 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2344  Tail Collar domain protein  42.11 
 
 		 82 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  29.63 
 
 		 173 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5767  putative phage tail Collar domain  30.53 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5676  tail collar domain-containing protein  33.64 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.204656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  32.56 
 
 		 173 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2442  Tail Collar domain protein  29.6 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2573  Tail Collar domain protein  35.51 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0519  Tail Collar domain protein  32.22 
 
 		 443 aa  45.8  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>