132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1349 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  100 
 
 
181 aa  371  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  50.84 
 
 
171 aa  181  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  48.07 
 
 
179 aa  167  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  48.62 
 
 
168 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  47.51 
 
 
169 aa  161  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  46.41 
 
 
167 aa  161  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03557  microcystin dependent protein  47.28 
 
 
181 aa  158  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  46.41 
 
 
175 aa  158  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  46.96 
 
 
165 aa  155  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  46.67 
 
 
171 aa  156  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  45.95 
 
 
173 aa  156  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  47.22 
 
 
172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  45.55 
 
 
181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  48.31 
 
 
166 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  45.16 
 
 
176 aa  149  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  47.78 
 
 
195 aa  148  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  45 
 
 
169 aa  148  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  42.86 
 
 
178 aa  148  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  43.78 
 
 
175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  44.44 
 
 
186 aa  145  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  44.02 
 
 
169 aa  145  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  43.89 
 
 
163 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  46.41 
 
 
173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  41.67 
 
 
174 aa  144  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  49.73 
 
 
167 aa  144  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  48.89 
 
 
173 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  41.99 
 
 
172 aa  144  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  44.32 
 
 
170 aa  142  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  43.89 
 
 
181 aa  141  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  43.55 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  43.09 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  42.47 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  40.98 
 
 
171 aa  139  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2454  phage tail Collar  45 
 
 
165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.45663  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  38.04 
 
 
179 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  38.67 
 
 
183 aa  135  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  42.93 
 
 
180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  45.16 
 
 
183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  41.29 
 
 
199 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  40.98 
 
 
170 aa  134  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  40 
 
 
182 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  41.01 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  41.11 
 
 
176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  44.57 
 
 
173 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  37.19 
 
 
196 aa  131  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  39.34 
 
 
176 aa  131  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  41.29 
 
 
199 aa  131  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  41.29 
 
 
199 aa  131  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  40.44 
 
 
177 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1453  Phage tail Collar  40.11 
 
 
187 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  39.34 
 
 
173 aa  130  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  39.49 
 
 
189 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  40.11 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  40.8 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  43.82 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  40.88 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  43.16 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  38.89 
 
 
176 aa  129  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  42.11 
 
 
173 aa  129  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  38.97 
 
 
189 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  42.39 
 
 
205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  40.35 
 
 
163 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  37.85 
 
 
170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  38.8 
 
 
180 aa  124  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  39.49 
 
 
195 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03559  microcystin dependent protein  41.01 
 
 
178 aa  121  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.536453  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  40.11 
 
 
199 aa  121  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  38.17 
 
 
184 aa  121  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  36.1 
 
 
206 aa  120  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  39.34 
 
 
199 aa  120  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  40.66 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  38.34 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  35.91 
 
 
172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  39.41 
 
 
157 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  39.2 
 
 
180 aa  114  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  37.38 
 
 
198 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  35.14 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  36.6 
 
 
195 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  36.76 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  39.18 
 
 
195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  40 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  38.59 
 
 
179 aa  106  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0053  phage tail collar domain-containing protein  34.27 
 
 
209 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  52.48 
 
 
211 aa  101  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  34.63 
 
 
207 aa  97.8  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  45.54 
 
 
210 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4767  phage tail collar domain-containing protein  64.52 
 
 
80 aa  91.7  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.428551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6119  Tail Collar domain protein  39.44 
 
 
172 aa  91.3  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2491  Tail Collar domain protein  65.08 
 
 
80 aa  89.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  32.85 
 
 
204 aa  88.2  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4722  phage tail collar domain-containing protein  60.32 
 
 
80 aa  87.8  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  33.18 
 
 
224 aa  87.8  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  33.01 
 
 
203 aa  86.3  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4046  phage tail collar domain-containing protein  39.13 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0754  phage tail collar domain-containing protein  52.94 
 
 
80 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2887  Tail Collar domain protein  58.33 
 
 
80 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00705187  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2493  Tail Collar domain protein  60 
 
 
81 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4048  phage tail collar domain-containing protein  36.07 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2343  Tail Collar domain protein  50 
 
 
80 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.607801 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2124  Tail Collar domain protein  58.93 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.258175 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>