134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3173 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  100 
 
 		 179 aa  366  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  52.25 
 
 		 171 aa  192  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  48.48 
 
 		 199 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  47.98 
 
 		 199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  47.98 
 
 		 199 aa  188  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  49.49 
 
 		 199 aa  184  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  51.69 
 
 		 168 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  49.21 
 
 		 189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  49.21 
 
 		 189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  51.37 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  52.22 
 
 		 175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  48.31 
 
 		 174 aa  178  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  51.11 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  48.88 
 
 		 173 aa  176  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  49.16 
 
 		 172 aa  175  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  48.59 
 
 		 176 aa  170  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  48.07 
 
 		 181 aa  167  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  48.31 
 
 		 195 aa  165  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  46.63 
 
 		 176 aa  164  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  45.98 
 
 		 199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  46.41 
 
 		 169 aa  161  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  47.75 
 
 		 173 aa  160  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  47.16 
 
 		 197 aa  158  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  47.22 
 
 		 169 aa  158  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  46.63 
 
 		 175 aa  158  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  47.13 
 
 		 171 aa  157  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  44.94 
 
 		 172 aa  153  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  42.7 
 
 		 176 aa  151  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  41.85 
 
 		 182 aa  151  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  46.59 
 
 		 180 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  42.7 
 
 		 165 aa  150  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  41.92 
 
 		 198 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  43.02 
 
 		 169 aa  149  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  44.44 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  43.65 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  43.82 
 
 		 173 aa  148  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  42.61 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03557  microcystin dependent protein  43.48 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  43.01 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  43.24 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  41.15 
 
 		 196 aa  144  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  40.88 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  41.67 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  39.09 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  42.41 
 
 		 183 aa  141  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  45.11 
 
 		 167 aa  141  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  44.51 
 
 		 176 aa  141  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  37.86 
 
 		 206 aa  140  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2454  phage tail Collar  44.38 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.45663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  42.7 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  41.27 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  42.55 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  39.01 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  41.34 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  42.16 
 
 		 180 aa  137  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  41.57 
 
 		 163 aa  137  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  47.75 
 
 		 167 aa  137  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  43.78 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  39.89 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  42.13 
 
 		 171 aa  136  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1453  Phage tail Collar  38.92 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  40.22 
 
 		 173 aa  134  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  43.96 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  41.57 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03559  microcystin dependent protein  40.91 
 
 		 178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.536453  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  39.2 
 
 		 170 aa  133  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  38.46 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  40.11 
 
 		 182 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  41.38 
 
 		 170 aa  132  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  40.44 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  38.2 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  40.56 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  40.32 
 
 		 186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  39.88 
 
 		 163 aa  127  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  39.79 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  40.41 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  41.48 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  40.76 
 
 		 175 aa  124  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  37.72 
 
 		 157 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  36.79 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  34.47 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  37.5 
 
 		 184 aa  114  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  38.57 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4048  phage tail collar domain-containing protein  42.37 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0053  phage tail collar domain-containing protein  35.58 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  36.76 
 
 		 183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6119  Tail Collar domain protein  40.34 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4767  phage tail collar domain-containing protein  69.35 
 
 		 80 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.428551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  30.69 
 
 		 204 aa  98.6  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  46 
 
 		 210 aa  98.2  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4046  phage tail collar domain-containing protein  39.23 
 
 		 179 aa  96.7  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  31.19 
 
 		 203 aa  93.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  29.73 
 
 		 224 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4722  phage tail collar domain-containing protein  60.66 
 
 		 80 aa  87.4  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2887  Tail Collar domain protein  58.33 
 
 		 80 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00705187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2124  Tail Collar domain protein  64.29 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0471  Tail Collar domain protein  31.95 
 
 		 246 aa  77.4  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  33.33 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2493  Tail Collar domain protein  53.33 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0566  Tail Collar domain protein  41.24 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>