132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4767 on replicon NC_008761
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008761  Pnap_4767  phage tail collar domain-containing protein  100 
 
 		 80 aa  165  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.428551 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4722  phage tail collar domain-containing protein  78.48 
 
 		 80 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0595  phage tail collar domain-containing protein  77.22 
 
 		 80 aa  110  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2491  Tail Collar domain protein  63.29 
 
 		 80 aa  103  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0754  phage tail collar domain-containing protein  58.23 
 
 		 80 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2887  Tail Collar domain protein  60.76 
 
 		 80 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00705187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  70.97 
 
 		 199 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  70.97 
 
 		 199 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  69.35 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  70.97 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  70.97 
 
 		 199 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  69.35 
 
 		 167 aa  98.6  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  63.49 
 
 		 168 aa  98.2  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  70.97 
 
 		 175 aa  98.6  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  60.27 
 
 		 169 aa  98.2  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  68.25 
 
 		 171 aa  97.4  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  69.35 
 
 		 173 aa  97.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2124  Tail Collar domain protein  59.52 
 
 		 84 aa  97.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  73.33 
 
 		 181 aa  97.4  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  66.13 
 
 		 171 aa  97.1  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  71.67 
 
 		 180 aa  96.7  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  66.13 
 
 		 163 aa  96.7  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  69.84 
 
 		 181 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  65.08 
 
 		 182 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  65.08 
 
 		 195 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  66.67 
 
 		 165 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  69.35 
 
 		 173 aa  94.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  66.13 
 
 		 175 aa  94.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  62.12 
 
 		 173 aa  94.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  69.35 
 
 		 183 aa  94.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  58.06 
 
 		 169 aa  94  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  56.41 
 
 		 172 aa  93.6  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  69.35 
 
 		 173 aa  93.6  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  69.84 
 
 		 177 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  62.9 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0486  Tail Collar domain protein  56.25 
 
 		 87 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  67.8 
 
 		 195 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  62.9 
 
 		 189 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  62.9 
 
 		 189 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2344  Tail Collar domain protein  53.09 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  65.57 
 
 		 170 aa  92  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  62.9 
 
 		 176 aa  91.7  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  64.52 
 
 		 181 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  70.69 
 
 		 172 aa  91.3  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  58.73 
 
 		 183 aa  90.9  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  61.67 
 
 		 199 aa  90.9  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2343  Tail Collar domain protein  51.9 
 
 		 80 aa  90.9  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.607801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  56.16 
 
 		 166 aa  90.5  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  67.8 
 
 		 167 aa  90.5  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2493  Tail Collar domain protein  51.95 
 
 		 81 aa  90.1  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2885  Tail Collar domain protein  51.85 
 
 		 84 aa  89.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000255968  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  61.76 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  61.29 
 
 		 174 aa  88.6  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  60.32 
 
 		 179 aa  88.2  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  59.7 
 
 		 206 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  55.26 
 
 		 181 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  61.9 
 
 		 178 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  61.29 
 
 		 173 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0269  tail collar domain-containing protein  54.43 
 
 		 78 aa  87.8  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0994346 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  65.57 
 
 		 211 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  62.9 
 
 		 176 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  58.73 
 
 		 166 aa  87.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  65.08 
 
 		 195 aa  87  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  62.71 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  57.14 
 
 		 176 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  59.68 
 
 		 176 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  65 
 
 		 176 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  54.84 
 
 		 179 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  60.32 
 
 		 192 aa  84.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  56.45 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  58.06 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  58.33 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  61.9 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  57.14 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03559  microcystin dependent protein  60.71 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.536453  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  50 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  58.06 
 
 		 198 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  51.61 
 
 		 205 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03557  microcystin dependent protein  61.29 
 
 		 181 aa  80.1  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  55.93 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  60.34 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  52.46 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2884  Tail Collar domain protein  50 
 
 		 81 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000266476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  55.56 
 
 		 180 aa  77  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  54.1 
 
 		 175 aa  77  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  50.79 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  52.24 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  46.05 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  58.33 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  53.23 
 
 		 204 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2454  phage tail Collar  56.76 
 
 		 165 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.45663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  56.14 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  57.63 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  54.24 
 
 		 210 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  50.79 
 
 		 157 aa  72  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1453  Phage tail Collar  51.61 
 
 		 187 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0753  phage tail collar domain-containing protein  54.32 
 
 		 82 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0792659  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  50 
 
 		 184 aa  70.1  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  43.55 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  52.46 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>