138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2872 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  100 
 
 
179 aa  356  9.999999999999999e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  49.5 
 
 
196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  50.81 
 
 
181 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  49.44 
 
 
176 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  46.77 
 
 
189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  47.06 
 
 
189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  43.65 
 
 
199 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  43.65 
 
 
199 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  43.65 
 
 
199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  45.56 
 
 
180 aa  164  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  44.72 
 
 
199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  45.86 
 
 
181 aa  159  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  45.13 
 
 
195 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  44.94 
 
 
171 aa  155  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  45 
 
 
171 aa  153  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  47.25 
 
 
173 aa  151  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  48.9 
 
 
173 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  43.96 
 
 
175 aa  148  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  43.07 
 
 
195 aa  148  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  43.62 
 
 
176 aa  147  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  41.57 
 
 
172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  46.7 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  45.41 
 
 
168 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  45.61 
 
 
163 aa  143  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  42.86 
 
 
169 aa  140  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4048  phage tail collar domain-containing protein  47.49 
 
 
179 aa  140  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  44.51 
 
 
176 aa  140  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  44.27 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  41.27 
 
 
179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  42.13 
 
 
173 aa  137  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  41.76 
 
 
177 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  38.97 
 
 
198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  43.01 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  42.16 
 
 
179 aa  134  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  42.08 
 
 
178 aa  134  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  41.9 
 
 
175 aa  132  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  41.01 
 
 
171 aa  131  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  36.87 
 
 
174 aa  131  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  43.59 
 
 
195 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  41.34 
 
 
170 aa  130  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  38.67 
 
 
176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  43.26 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  44.89 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  42.62 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  38.59 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  43.58 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  40.34 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4046  phage tail collar domain-containing protein  45.56 
 
 
179 aa  129  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  40.78 
 
 
170 aa  128  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  40.91 
 
 
169 aa  124  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  36.45 
 
 
206 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  39.13 
 
 
178 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  40.68 
 
 
165 aa  124  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  38.42 
 
 
180 aa  123  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  42.86 
 
 
176 aa  122  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  40.45 
 
 
163 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  40.33 
 
 
199 aa  121  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  39.78 
 
 
197 aa  121  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  37.64 
 
 
176 aa  121  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  41.67 
 
 
172 aa  120  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  36.17 
 
 
205 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2454  phage tail Collar  42.7 
 
 
165 aa  117  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.45663  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  41.62 
 
 
181 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  39.56 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  39.44 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0053  phage tail collar domain-containing protein  35.1 
 
 
209 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  37.89 
 
 
182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  40 
 
 
172 aa  114  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  39.34 
 
 
180 aa  114  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6119  Tail Collar domain protein  40.45 
 
 
172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  35.63 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  44.38 
 
 
167 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  37.76 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  36.36 
 
 
181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1453  Phage tail Collar  37.7 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  32.32 
 
 
196 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  35.55 
 
 
207 aa  111  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  40 
 
 
175 aa  111  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  36.36 
 
 
177 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  38.04 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  36.74 
 
 
204 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  35.33 
 
 
184 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  39.2 
 
 
170 aa  107  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  38.59 
 
 
181 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  37.22 
 
 
224 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  35.58 
 
 
210 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03557  microcystin dependent protein  36.98 
 
 
181 aa  104  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  35.26 
 
 
186 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  40.11 
 
 
173 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  37.8 
 
 
211 aa  99  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03559  microcystin dependent protein  35.14 
 
 
178 aa  94.4  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.536453  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  33.82 
 
 
203 aa  92.4  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4722  phage tail collar domain-containing protein  61.29 
 
 
80 aa  89  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4767  phage tail collar domain-containing protein  60.32 
 
 
80 aa  88.2  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.428551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  37.34 
 
 
264 aa  84  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2124  Tail Collar domain protein  61.4 
 
 
84 aa  82  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0873  Tail Collar domain protein  55.56 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.379708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0754  phage tail collar domain-containing protein  52.7 
 
 
80 aa  79  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2491  Tail Collar domain protein  57.14 
 
 
80 aa  79  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2343  Tail Collar domain protein  58.73 
 
 
80 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.607801 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>