41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3075 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3075  putative phage tail collar domain  100 
 
 		 326 aa  664    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.242473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5767  putative phage tail Collar domain  45.72 
 
 		 300 aa  235  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2573  Tail Collar domain protein  35.57 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2442  Tail Collar domain protein  33.84 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5676  tail collar domain-containing protein  28.06 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.204656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6751  hypothetical protein  32.71 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  27.15 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1749  Tail Collar domain protein  30.86 
 
 		 261 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0519  Tail Collar domain protein  39.56 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  34.36 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5675  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1065 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  30.49 
 
 		 169 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  30.81 
 
 		 180 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  29.44 
 
 		 176 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  29.1 
 
 		 492 aa  49.7  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  26.29 
 
 		 170 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  31.67 
 
 		 483 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  29.63 
 
 		 178 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  30.91 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0240  microcystin-dependent protein-like  33.33 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  28.66 
 
 		 165 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  31.41 
 
 		 176 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  31.21 
 
 		 169 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  27.81 
 
 		 182 aa  46.6  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  33.92 
 
 		 199 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  33.92 
 
 		 199 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  30.89 
 
 		 172 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  28.92 
 
 		 182 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  37.39 
 
 		 199 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  33.92 
 
 		 199 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  28.22 
 
 		 264 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  34.48 
 
 		 196 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  26.51 
 
 		 163 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  30.3 
 
 		 181 aa  43.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  29.81 
 
 		 654 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  29.81 
 
 		 654 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  29.68 
 
 		 171 aa  43.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  29.01 
 
 		 183 aa  43.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0236  hypothetical protein  40.38 
 
 		 64 aa  43.1  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.660822  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  31 
 
 		 501 aa  42.7  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  30.5 
 
 		 173 aa  42.7  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>