14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0889 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0889  hypothetical protein  100 
 
 		 656 aa  1331    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  53.54 
 
 		 501 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1159  hypothetical protein  41.09 
 
 		 530 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0356  hypothetical protein  41.09 
 
 		 323 aa  197  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0398  hypothetical protein  40.73 
 
 		 530 aa  195  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.738816  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1137  hypothetical protein  40.73 
 
 		 530 aa  195  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.757032  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0190  hypothetical protein  49.05 
 
 		 569 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  51.5 
 
 		 790 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  49.43 
 
 		 536 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4955  hypothetical protein  42.99 
 
 		 616 aa  158  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3056  pyocin R2_PP, tail fiber protein, putative  35.34 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172022 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3850  complement C1q protein  30.48 
 
 		 781 aa  57  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1209  putative pyocin R2_PP, tail fiber protein  33.93 
 
 		 228 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391701 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5520  hypothetical protein  55.26 
 
 		 1012 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>