14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1137 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0398  hypothetical protein  100 
 
 
530 aa  1085    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.738816  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1137  hypothetical protein  100 
 
 
530 aa  1085    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.757032  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1159  hypothetical protein  97.55 
 
 
530 aa  1058    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0356  hypothetical protein  89.1 
 
 
323 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  46.56 
 
 
501 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0889  hypothetical protein  40.73 
 
 
656 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  48.28 
 
 
536 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  46.28 
 
 
790 aa  148  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0190  hypothetical protein  47.56 
 
 
569 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872884 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4955  hypothetical protein  42.29 
 
 
616 aa  142  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194752  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3850  complement C1q protein  30.71 
 
 
781 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2909  hypothetical protein  30.77 
 
 
492 aa  44.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1209  putative pyocin R2_PP, tail fiber protein  31.15 
 
 
228 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391701 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3500  hypothetical protein  32.47 
 
 
899 aa  43.5  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.512789  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>