22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4534 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4534  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  743    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  0.857374 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3344  hypothetical protein  34.68 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3469  Hep_Hag  30.03 
 
 		 777 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259932  normal  0.0166964 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3468  Hep_Hag  28.05 
 
 		 843 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0186324  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5099  hypothetical protein  30.92 
 
 		 690 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0500  hypothetical protein  28.23 
 
 		 619 aa  77  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.892489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1625  hypothetical protein  36.75 
 
 		 579 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0602  hypothetical protein  31.87 
 
 		 449 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0603  hypothetical protein  30.17 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2192  hypothetical protein  36.54 
 
 		 770 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000184948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3423  hypothetical protein  32.41 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1014  hypothetical protein  31.96 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963596 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1675  hypothetical protein  27.88 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1111  Hep_Hag repeat-containing protein  35.44 
 
 		 464 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  33.07 
 
 		 4526 aa  47.8  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4085  hypothetical protein  36.71 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1361  hypothetical protein  34.18 
 
 		 462 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1323  hypothetical protein  35.44 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0917  Hep_Hag repeat-containing protein  32.5 
 
 		 442 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1285  hypothetical protein  34.18 
 
 		 462 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1098  hypothetical protein  34.18 
 
 		 462 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1104  hypothetical protein  34.18 
 
 		 462 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>