49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3468 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3468  Hep_Hag  100 
 
 
843 aa  1679    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0186324  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3469  Hep_Hag  77.04 
 
 
777 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259932  normal  0.0166964 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2109  hypothetical protein  67.2 
 
 
761 aa  456  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0352  hypothetical protein  64.46 
 
 
1037 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197071  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4198  hypothetical protein  65.37 
 
 
881 aa  419  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.26199  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1112  hypothetical protein  54.83 
 
 
735 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3200  hypothetical protein  58.89 
 
 
824 aa  383  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202972  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2049  hypothetical protein  56.38 
 
 
746 aa  379  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2741  hypothetical protein  53.1 
 
 
804 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.732341 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1914  hypothetical protein  59.13 
 
 
726 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.785676 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1354  hypothetical protein  60.45 
 
 
647 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1334  hypothetical protein  55.32 
 
 
747 aa  363  9e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329059  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0536  hypothetical protein  53.89 
 
 
776 aa  362  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.664804  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0354  hypothetical protein  57.07 
 
 
689 aa  348  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.426048 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0191  hypothetical protein  51.13 
 
 
729 aa  337  7e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.496537  normal  0.259383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1909  hypothetical protein  51.94 
 
 
628 aa  329  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383493  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0190  hypothetical protein  46.15 
 
 
722 aa  329  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685735  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4089  hypothetical protein  52.93 
 
 
702 aa  314  4.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.331742  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2744  hypothetical protein  45.96 
 
 
759 aa  264  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.953888  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1615  hypothetical protein  44.53 
 
 
675 aa  241  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2296  hypothetical protein  30.6 
 
 
538 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3344  hypothetical protein  35.38 
 
 
434 aa  128  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2192  hypothetical protein  33.59 
 
 
770 aa  99  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000184948  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4534  hypothetical protein  28.29 
 
 
361 aa  97.8  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  0.857374 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5099  hypothetical protein  30.4 
 
 
690 aa  94  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0500  hypothetical protein  33.97 
 
 
619 aa  92  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.892489  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1625  hypothetical protein  36.43 
 
 
579 aa  80.1  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0603  hypothetical protein  31.17 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0602  hypothetical protein  27.68 
 
 
449 aa  71.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146379  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3423  hypothetical protein  28.89 
 
 
468 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1675  hypothetical protein  34.29 
 
 
435 aa  61.6  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2529  hypothetical protein  33.63 
 
 
456 aa  58.5  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0585489  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3346  hypothetical protein  36 
 
 
650 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1014  hypothetical protein  35 
 
 
381 aa  49.7  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.963596 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  40.85 
 
 
4238 aa  48.5  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3029  hypothetical protein  32.69 
 
 
323 aa  48.5  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  35.87 
 
 
1814 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  36.84 
 
 
3920 aa  47.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  46.27 
 
 
1674 aa  46.6  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  35.29 
 
 
998 aa  46.6  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  40.79 
 
 
4191 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  31.94 
 
 
1333 aa  45.8  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  39.51 
 
 
877 aa  45.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  29.71 
 
 
731 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  35.9 
 
 
3737 aa  45.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  37.5 
 
 
5143 aa  45.1  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  37.5 
 
 
2868 aa  45.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  42.03 
 
 
2914 aa  45.1  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  37.7 
 
 
1516 aa  44.7  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>