20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0500 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0500  hypothetical protein  100 
 
 
619 aa  1211    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.892489  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2192  hypothetical protein  38.3 
 
 
770 aa  200  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000184948  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5099  hypothetical protein  35.6 
 
 
690 aa  190  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3344  hypothetical protein  40.99 
 
 
434 aa  169  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3468  Hep_Hag  33.97 
 
 
843 aa  92  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0186324  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3469  Hep_Hag  32.78 
 
 
777 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259932  normal  0.0166964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0603  hypothetical protein  27.54 
 
 
427 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4534  hypothetical protein  27.24 
 
 
361 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  0.857374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0602  hypothetical protein  27.37 
 
 
449 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146379  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1675  hypothetical protein  34.62 
 
 
435 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3423  hypothetical protein  27.88 
 
 
468 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3139  hypothetical protein  40.32 
 
 
312 aa  70.1  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1625  hypothetical protein  37.04 
 
 
579 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2490  hypothetical protein  40.65 
 
 
745 aa  66.6  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1276  hypothetical protein  30.95 
 
 
177 aa  46.6  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.370677  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1014  hypothetical protein  32.26 
 
 
381 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.963596 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1688  hypothetical protein  35.19 
 
 
192 aa  46.2  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0063  hypothetical protein  32.84 
 
 
179 aa  44.3  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.261696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  37.7 
 
 
178 aa  44.3  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4464  hypothetical protein  29.51 
 
 
143 aa  43.9  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  normal  0.141209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>