44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4464 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4464  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  273  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0692  hypothetical protein  51.43 
 
 		 207 aa  98.2  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3196  hypothetical protein  56.12 
 
 		 209 aa  97.1  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  51 
 
 		 212 aa  95.9  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  41.6 
 
 		 257 aa  84.3  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  35.24 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0557  hypothetical protein  46.07 
 
 		 356 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1101  hypothetical protein  61.82 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4028  hypothetical protein  36.25 
 
 		 745 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2601  hypothetical protein  34.44 
 
 		 708 aa  58.9  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1337  hypothetical protein  36.89 
 
 		 335 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.629526 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0063  hypothetical protein  39.36 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.261696  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  27.2 
 
 		 278 aa  57.4  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1166  hypothetical protein  28.95 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6447  hypothetical protein  30.08 
 
 		 408 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2365  hypothetical protein  30.65 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035405  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05450  hypothetical protein  23.78 
 
 		 349 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1101  hypothetical protein  28.99 
 
 		 229 aa  45.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.558876 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0272  S-layer domain-containing protein  32.38 
 
 		 434 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0549  hypothetical protein  30 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4448  uncharacterized conserved protein containing internal repeats  27.08 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1276  hypothetical protein  26.26 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.370677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3579  phage minor structural protein  26.23 
 
 		 1564 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.790906  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.48 
 
 		 1196 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1451  hypothetical protein  32.88 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000234748  normal  0.258105 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0500  hypothetical protein  29.51 
 
 		 619 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.892489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  27.05 
 
 		 1235 aa  42.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2700  hypothetical protein  19.54 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4769  hypothetical protein  36.21 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0876  paREP15, putative coiled-coil protein  29.69 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1460  syntaxin domain-containing protein  32.93 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.681361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.75 
 
 		 1072 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0969  KID repeat-containing protein  25.77 
 
 		 1702 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1151  hypothetical protein  32.84 
 
 		 386 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1806  hypothetical protein  22.32 
 
 		 595 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  25 
 
 		 384 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0570  paREP5a  27.59 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  29.17 
 
 		 892 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1667  hypothetical protein  36.67 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.57828  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1219  hypothetical protein  29.25 
 
 		 567 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000368049 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0326  paREP15, putative coiled-coil protein  27.27 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0971098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0621  hypothetical protein  24.74 
 
 		 292 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149956  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  29.84 
 
 		 1036 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2452  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.43 
 
 		 204 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.633418  normal  0.137413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>