14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2490 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2490  hypothetical protein  100 
 
 		 745 aa  1447    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2930  prophage MuMc02, head decoration protein, putative  47.29 
 
 		 466 aa  110  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100371  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  43.36 
 
 		 689 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  39.35 
 
 		 817 aa  92  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1223  hypothetical protein  50.5 
 
 		 263 aa  92  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.241489  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  38.97 
 
 		 554 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  38.1 
 
 		 714 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2192  hypothetical protein  41.88 
 
 		 770 aa  68.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000184948  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7159  hypothetical protein  55.1 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.508874 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0500  hypothetical protein  40.49 
 
 		 619 aa  66.2  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.892489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5099  hypothetical protein  45.9 
 
 		 690 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  38.89 
 
 		 5166 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  37.96 
 
 		 5203 aa  54.3  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3139  hypothetical protein  42.11 
 
 		 312 aa  53.5  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>