199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3487 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  81.69 
 
 
1349 aa  1583    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 
1570 aa  3156    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  74.12 
 
 
1391 aa  1580    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  45.96 
 
 
568 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  46.35 
 
 
568 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  46.36 
 
 
595 aa  432  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  45.94 
 
 
608 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  44.42 
 
 
595 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  44.01 
 
 
580 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1755  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.24 
 
 
965 aa  413  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  40.84 
 
 
588 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0379  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.28 
 
 
1073 aa  399  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0161593  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  41.4 
 
 
585 aa  397  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0285  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  31.32 
 
 
1195 aa  380  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579969  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0285  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.08 
 
 
1202 aa  380  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  40.16 
 
 
639 aa  370  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  40.16 
 
 
584 aa  370  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1390  filamentous haemagglutinin-like protein  30.75 
 
 
1033 aa  352  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.379495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  38.32 
 
 
584 aa  330  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  35.11 
 
 
692 aa  298  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1759  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.03 
 
 
758 aa  271  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4131  filamentous haemagglutinin-like protein  31.84 
 
 
848 aa  262  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.343736  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2352  filamentous haemagglutinin-like protein  29.07 
 
 
820 aa  259  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1630  surface antigen variable number  86.01 
 
 
143 aa  255  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.479161  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3442  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.46 
 
 
952 aa  250  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2674  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  29.33 
 
 
952 aa  249  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.89 
 
 
585 aa  245  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2353  filamentous haemagglutinin-like protein  31.85 
 
 
824 aa  233  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5479  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.61 
 
 
816 aa  231  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0834  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.67 
 
 
795 aa  231  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0180424 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0006  filamentous haemagglutinin-like protein  29.99 
 
 
845 aa  227  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2349  filamentous haemagglutinin-like protein  30.31 
 
 
804 aa  221  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2972  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.36 
 
 
823 aa  221  8.999999999999998e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3737  filamentous haemagglutinin-like protein  30.69 
 
 
805 aa  220  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2351  filamentous haemagglutinin-like protein  30.67 
 
 
830 aa  216  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5640  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.17 
 
 
822 aa  215  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00258784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  32.02 
 
 
587 aa  207  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2350  filamentous haemagglutinin-like protein  30.66 
 
 
816 aa  207  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.883366  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2530  filamentous haemagglutinin-like protein  30.58 
 
 
776 aa  197  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.957928 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2811  filamentous haemagglutinin-like protein  26.88 
 
 
1140 aa  184  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0282223  normal  0.417754 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5639  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.29 
 
 
533 aa  181  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000755047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4181  filamentous haemagglutinin-like protein  54.32 
 
 
759 aa  178  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153742 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0053  filamentous haemagglutinin-like protein  30.95 
 
 
811 aa  174  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.710253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2810  filamentous haemagglutinin-like protein  25.78 
 
 
1152 aa  158  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  normal  0.309212 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5478  surface antigen (D15)  29.42 
 
 
579 aa  155  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.56 
 
 
3298 aa  145  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.43 
 
 
3419 aa  144  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.27 
 
 
3535 aa  140  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1629  surface antigen variable number  91.55 
 
 
71 aa  135  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432291  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  24.75 
 
 
558 aa  128  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.94 
 
 
3299 aa  110  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.96 
 
 
572 aa  108  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.42 
 
 
567 aa  107  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.47 
 
 
747 aa  105  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.36 
 
 
3537 aa  104  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  24.02 
 
 
596 aa  100  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.02 
 
 
596 aa  100  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.82 
 
 
561 aa  99.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  24.02 
 
 
596 aa  97.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  24.67 
 
 
567 aa  95.9  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  24.89 
 
 
567 aa  95.5  7e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  24.89 
 
 
567 aa  95.5  7e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.85 
 
 
1772 aa  95.5  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  23.33 
 
 
550 aa  94.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  24.05 
 
 
554 aa  93.2  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  23.87 
 
 
531 aa  92.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.12 
 
 
541 aa  90.5  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.73 
 
 
573 aa  89.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.79 
 
 
576 aa  89  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  25.29 
 
 
590 aa  88.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2921  hemolysin activation/secretion protein  24.37 
 
 
593 aa  88.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.502908  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  23.8 
 
 
442 aa  87.4  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  23.25 
 
 
547 aa  87.4  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.06 
 
 
561 aa  87.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2226  hypothetical protein  23.85 
 
 
543 aa  86.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.933636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  23.56 
 
 
544 aa  86.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  24.06 
 
 
544 aa  85.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  24.03 
 
 
531 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  23.64 
 
 
550 aa  82  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  25 
 
 
599 aa  82  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0354  hemolysin activation/secretion protein  22.9 
 
 
555 aa  79.7  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0188948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  22.93 
 
 
575 aa  79.7  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.56 
 
 
538 aa  78.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.64 
 
 
546 aa  77.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.63 
 
 
553 aa  76.3  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  41.75 
 
 
1650 aa  75.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.88 
 
 
692 aa  75.5  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.72 
 
 
585 aa  75.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  23.82 
 
 
555 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2219  hemolysin activation/secretion protein  24.27 
 
 
575 aa  74.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0458384  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.16 
 
 
567 aa  73.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  45.71 
 
 
2637 aa  74.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  25.91 
 
 
553 aa  73.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  23.94 
 
 
574 aa  71.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  24.83 
 
 
562 aa  71.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  27.52 
 
 
565 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.84 
 
 
585 aa  71.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  23.78 
 
 
568 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  23.42 
 
 
568 aa  70.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  27.13 
 
 
562 aa  68.6  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>