207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2776 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  100 
 
 
562 aa  1133    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  61.37 
 
 
569 aa  676    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  99.82 
 
 
562 aa  1132    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  92.53 
 
 
562 aa  1061    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  93.13 
 
 
565 aa  1049    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  48.24 
 
 
570 aa  498  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.32 
 
 
557 aa  336  5.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.96 
 
 
554 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  32.25 
 
 
549 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.78 
 
 
554 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  32.85 
 
 
560 aa  300  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31 
 
 
558 aa  293  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  34.41 
 
 
585 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.83 
 
 
568 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  32.59 
 
 
573 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  30.86 
 
 
575 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.96 
 
 
591 aa  212  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.84 
 
 
591 aa  212  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.68 
 
 
591 aa  212  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  32.2 
 
 
561 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  33.05 
 
 
558 aa  211  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  31.98 
 
 
590 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  31.39 
 
 
578 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0300  hemolysin activator protein  28.54 
 
 
562 aa  207  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00625551  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  31.76 
 
 
590 aa  207  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.48 
 
 
592 aa  206  9e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  33.17 
 
 
562 aa  205  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.77 
 
 
580 aa  204  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.93 
 
 
562 aa  204  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  31.75 
 
 
588 aa  204  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.84 
 
 
584 aa  204  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.3 
 
 
582 aa  203  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4641  hemolysin activator protein  31.87 
 
 
570 aa  203  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6356  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.71 
 
 
563 aa  202  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.42 
 
 
586 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  32.45 
 
 
562 aa  200  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  32.38 
 
 
582 aa  200  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  30.69 
 
 
562 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.69 
 
 
562 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.9 
 
 
595 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.65 
 
 
594 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  31.06 
 
 
584 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.2 
 
 
593 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.57 
 
 
592 aa  194  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  30.19 
 
 
586 aa  193  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  30.86 
 
 
585 aa  193  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  30.19 
 
 
586 aa  193  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  30.86 
 
 
585 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  30.86 
 
 
568 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  31.42 
 
 
584 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2439  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  28.22 
 
 
553 aa  186  8e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155436  decreased coverage  0.0000110124 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2040  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.49 
 
 
581 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.354299  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2157  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  28.42 
 
 
553 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1450  TPS family activation/secretion protein  30.99 
 
 
565 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.25 
 
 
563 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  29.16 
 
 
564 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  29.96 
 
 
583 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2045  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  29.12 
 
 
513 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102664  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  29.09 
 
 
581 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.29 
 
 
565 aa  181  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.51 
 
 
574 aa  181  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.22 
 
 
575 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0484  hemolysin activator HlyB  29.57 
 
 
572 aa  178  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4271  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.2 
 
 
560 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214751  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  27.89 
 
 
578 aa  177  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  30.66 
 
 
583 aa  177  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0371  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.05 
 
 
585 aa  174  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  28.84 
 
 
558 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  28.84 
 
 
558 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.38 
 
 
559 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  28.54 
 
 
554 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2342  HlyB family hemolysin activator protein  28.57 
 
 
554 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  28.88 
 
 
551 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  28.54 
 
 
554 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.24 
 
 
610 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.44 
 
 
608 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4078  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.31 
 
 
581 aa  164  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1757  HlyB family hemolysin activator protein  29.15 
 
 
520 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.598538  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02975  outer membrane hemolysin activator protein  28.15 
 
 
570 aa  159  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  28.27 
 
 
602 aa  156  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.65 
 
 
570 aa  154  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  24.14 
 
 
539 aa  152  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395972 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.61 
 
 
566 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3716  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.81 
 
 
593 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  27.57 
 
 
574 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4730  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  24.49 
 
 
550 aa  144  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370373  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.11 
 
 
580 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.12 
 
 
568 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.99 
 
 
597 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1537  putative hemolysin activation protein HecB  23.12 
 
 
566 aa  131  4.0000000000000003e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.395998  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0086  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.75 
 
 
587 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4076  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  26.59 
 
 
556 aa  127  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0608  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase; ATP-PRT)  21.13 
 
 
590 aa  125  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1681  putative periplasmic protein  20.8 
 
 
590 aa  124  5e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  27.37 
 
 
553 aa  113  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  22.63 
 
 
584 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.65 
 
 
747 aa  96.7  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  26.44 
 
 
558 aa  95.1  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0745  haemolysin secretion/activation protein ShlB/FhaC/HecB  20.87 
 
 
547 aa  95.1  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.39 
 
 
561 aa  92.8  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>