101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1064 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  100 
 
 
587 aa  1184    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  42.78 
 
 
692 aa  420  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  41.72 
 
 
585 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  33.86 
 
 
585 aa  277  4e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  34.93 
 
 
584 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  33.52 
 
 
588 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  35.71 
 
 
580 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  34.18 
 
 
595 aa  256  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  32.93 
 
 
568 aa  246  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  32.26 
 
 
608 aa  243  9e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  33.13 
 
 
568 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  33.2 
 
 
595 aa  236  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.54 
 
 
1391 aa  232  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.17 
 
 
1349 aa  229  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.02 
 
 
1570 aa  224  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.91 
 
 
639 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.72 
 
 
584 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  26.48 
 
 
558 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5639  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.35 
 
 
533 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000755047 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5478  surface antigen (D15)  26.52 
 
 
579 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  28.42 
 
 
550 aa  101  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  26.56 
 
 
553 aa  100  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.87 
 
 
583 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.21 
 
 
543 aa  91.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.95 
 
 
567 aa  88.2  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.67 
 
 
747 aa  86.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  26.19 
 
 
607 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  25.28 
 
 
554 aa  84  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.81 
 
 
554 aa  82.4  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  24.04 
 
 
555 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  26.88 
 
 
545 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.06 
 
 
569 aa  78.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.42 
 
 
567 aa  77.4  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.39 
 
 
554 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.14 
 
 
546 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.04 
 
 
561 aa  74.7  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.05 
 
 
586 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1630  surface antigen variable number  37.6 
 
 
143 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.479161  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  26.09 
 
 
596 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.09 
 
 
596 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  26.09 
 
 
596 aa  71.2  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.78 
 
 
585 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.13 
 
 
568 aa  68.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.81 
 
 
573 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.12 
 
 
572 aa  68.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  25.59 
 
 
556 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.8 
 
 
554 aa  67.4  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.14 
 
 
554 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.17 
 
 
692 aa  65.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  25.84 
 
 
568 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.56 
 
 
558 aa  64.3  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  25.63 
 
 
568 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  22.54 
 
 
442 aa  63.5  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2226  hypothetical protein  23.14 
 
 
543 aa  62.4  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.933636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.64 
 
 
578 aa  62  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  25.83 
 
 
575 aa  60.1  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.15 
 
 
590 aa  59.7  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.69 
 
 
576 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.68 
 
 
541 aa  60.1  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  22.48 
 
 
531 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  23.28 
 
 
599 aa  56.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  22.05 
 
 
531 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  23.84 
 
 
607 aa  55.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.68 
 
 
560 aa  55.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  22.25 
 
 
597 aa  55.1  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  22.05 
 
 
544 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  24.05 
 
 
567 aa  53.5  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  24.05 
 
 
567 aa  53.5  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  24.05 
 
 
567 aa  53.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0354  hemolysin activation/secretion protein  23.63 
 
 
555 aa  51.6  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0188948 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.06 
 
 
574 aa  51.6  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.87 
 
 
559 aa  51.2  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  21.32 
 
 
544 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.2 
 
 
585 aa  50.8  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.88 
 
 
549 aa  50.4  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0745  haemolysin secretion/activation protein ShlB/FhaC/HecB  21.73 
 
 
547 aa  50.4  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.48 
 
 
595 aa  50.4  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  22.53 
 
 
569 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35 
 
 
772 aa  49.3  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.19 
 
 
591 aa  49.7  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  21.76 
 
 
550 aa  48.9  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.19 
 
 
591 aa  48.5  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.19 
 
 
591 aa  48.5  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.71 
 
 
592 aa  48.9  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  21.39 
 
 
576 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  20.96 
 
 
590 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.71 
 
 
538 aa  47.4  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  23.12 
 
 
548 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  21.64 
 
 
547 aa  46.2  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  22.28 
 
 
562 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  22.42 
 
 
565 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.24 
 
 
557 aa  45.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3409  surface antigen (D15)  38.95 
 
 
430 aa  44.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  26.05 
 
 
551 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  26.05 
 
 
554 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  37.23 
 
 
414 aa  44.3  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  35.11 
 
 
416 aa  43.9  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  34.04 
 
 
414 aa  43.9  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  26.05 
 
 
558 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  26.05 
 
 
558 aa  43.9  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>