158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3061 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 
578 aa  1170    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  40.96 
 
 
548 aa  352  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  34.28 
 
 
553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.33 
 
 
572 aa  259  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  30.59 
 
 
550 aa  242  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  32.84 
 
 
554 aa  237  4e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.94 
 
 
554 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.78 
 
 
585 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  29.74 
 
 
607 aa  220  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.88 
 
 
586 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.33 
 
 
569 aa  217  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.12 
 
 
583 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  30.47 
 
 
556 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.72 
 
 
554 aa  210  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  31.81 
 
 
567 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  31.3 
 
 
567 aa  200  7e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  31.3 
 
 
567 aa  200  7e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  29.39 
 
 
545 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  32.43 
 
 
442 aa  192  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.75 
 
 
561 aa  188  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.52 
 
 
567 aa  169  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  27.73 
 
 
576 aa  162  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.38 
 
 
596 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  25.38 
 
 
596 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  25.38 
 
 
596 aa  156  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.15 
 
 
595 aa  154  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  28.04 
 
 
576 aa  150  5e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.06 
 
 
545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.16 
 
 
571 aa  147  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  27.89 
 
 
581 aa  146  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  29.27 
 
 
575 aa  143  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.12 
 
 
592 aa  138  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.88 
 
 
574 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.47 
 
 
590 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.11 
 
 
747 aa  128  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  25.88 
 
 
558 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  25.97 
 
 
568 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  25.75 
 
 
568 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.55 
 
 
692 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.85 
 
 
581 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.85 
 
 
581 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.22 
 
 
553 aa  99.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.68 
 
 
543 aa  96.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  23.17 
 
 
692 aa  95.1  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.81 
 
 
567 aa  93.6  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  26.45 
 
 
551 aa  92.8  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  26.45 
 
 
551 aa  92.8  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  23.08 
 
 
557 aa  92.8  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  22.16 
 
 
555 aa  90.1  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.52 
 
 
561 aa  90.1  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.74 
 
 
559 aa  88.6  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  25.1 
 
 
599 aa  88.2  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  23.74 
 
 
595 aa  84.7  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  22.3 
 
 
569 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  23.47 
 
 
558 aa  83.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.69 
 
 
565 aa  82.8  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  22.4 
 
 
555 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  24.84 
 
 
597 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.64 
 
 
580 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.46 
 
 
557 aa  80.9  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  23.95 
 
 
508 aa  80.5  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.3 
 
 
597 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  22.87 
 
 
551 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.46 
 
 
569 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0771  polypeptide-transport-associated domain protein, ShlB-type  29.26 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.891277 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  22.18 
 
 
559 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  21.98 
 
 
551 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  21.98 
 
 
551 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  22.18 
 
 
551 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  21.98 
 
 
551 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  21.98 
 
 
559 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1655  hypothetical protein  23.01 
 
 
588 aa  77.4  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  21.44 
 
 
608 aa  77.4  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.27 
 
 
546 aa  75.1  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.09 
 
 
610 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  21.73 
 
 
565 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.68 
 
 
561 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  21.75 
 
 
597 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  23.9 
 
 
570 aa  72.4  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.5 
 
 
561 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.86 
 
 
560 aa  71.6  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.5 
 
 
561 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.39 
 
 
561 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  23.42 
 
 
590 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.04 
 
 
558 aa  69.3  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  22.07 
 
 
569 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.52 
 
 
548 aa  69.3  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  24.04 
 
 
607 aa  68.6  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  22.82 
 
 
1391 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.32 
 
 
585 aa  68.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  19.53 
 
 
544 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0055  hemolysin activation/secretion protein-like  24.38 
 
 
533 aa  66.6  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193341  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.02 
 
 
1570 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  20.13 
 
 
584 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  23.35 
 
 
558 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  21.72 
 
 
561 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.33 
 
 
1349 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.72 
 
 
561 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  21.62 
 
 
550 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  19.79 
 
 
544 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>