174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6061 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  100 
 
 		 599 aa  1206    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  29.41 
 
 		 568 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  29.61 
 
 		 568 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.08 
 
 		 559 aa  140  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.87 
 
 		 567 aa  140  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4591  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.24 
 
 		 552 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0179388 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.49 
 
 		 561 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.49 
 
 		 561 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  28.88 
 
 		 550 aa  126  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  26.2 
 
 		 561 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.2 
 
 		 561 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.69 
 
 		 548 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2383  hemolysin activation/secretion protein-like  25.9 
 
 		 624 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418836  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.75 
 
 		 560 aa  124  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  29.06 
 
 		 553 aa  123  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  27.45 
 
 		 561 aa  123  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  24.21 
 
 		 558 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.56 
 
 		 572 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  27.5 
 
 		 607 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3190  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.59 
 
 		 589 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.75 
 
 		 561 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  26.82 
 
 		 574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.03 
 
 		 569 aa  118  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.94 
 
 		 569 aa  114  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.95 
 
 		 561 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  25.39 
 
 		 569 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.77 
 
 		 554 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.64 
 
 		 553 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.17 
 
 		 554 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  23.9 
 
 		 555 aa  109  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  24.36 
 
 		 551 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  24.16 
 
 		 559 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  24.16 
 
 		 559 aa  107  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  24.16 
 
 		 551 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  24.16 
 
 		 551 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  24.16 
 
 		 551 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  26.86 
 
 		 548 aa  107  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  24.16 
 
 		 551 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.5 
 
 		 561 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.6 
 
 		 581 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  23.76 
 
 		 597 aa  104  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.6 
 
 		 581 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  28.03 
 
 		 558 aa  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.66 
 
 		 747 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  27.14 
 
 		 607 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  25.19 
 
 		 567 aa  101  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  24.95 
 
 		 692 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  25.1 
 
 		 567 aa  100  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  25.1 
 
 		 567 aa  100  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  24.75 
 
 		 557 aa  100  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2460  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.21 
 
 		 587 aa  98.6  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118018  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  27.15 
 
 		 576 aa  97.1  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  24.27 
 
 		 558 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.71 
 
 		 583 aa  96.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  26.07 
 
 		 565 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  27.13 
 
 		 556 aa  95.9  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.74 
 
 		 585 aa  96.3  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2095  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.68 
 
 		 592 aa  95.5  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  29.3 
 
 		 545 aa  94  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27 
 
 		 595 aa  93.2  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  26.15 
 
 		 576 aa  92.4  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  25.62 
 
 		 562 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.98 
 
 		 538 aa  91.3  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  23.37 
 
 		 565 aa  89  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.77 
 
 		 554 aa  88.6  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.9 
 
 		 571 aa  88.6  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.05 
 
 		 578 aa  88.2  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  25.84 
 
 		 554 aa  87.8  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.88 
 
 		 639 aa  87  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.88 
 
 		 584 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.64 
 
 		 692 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.63 
 
 		 585 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  25.71 
 
 		 562 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  25.41 
 
 		 587 aa  85.1  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  25.71 
 
 		 562 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  27.11 
 
 		 588 aa  84.7  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  23.39 
 
 		 590 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  25.58 
 
 		 585 aa  84  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.85 
 
 		 538 aa  83.6  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.9 
 
 		 1570 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.1 
 
 		 1391 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  23.3 
 
 		 584 aa  81.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5786  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.14 
 
 		 592 aa  80.5  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.564372  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.9 
 
 		 1349 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0147  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.41 
 
 		 572 aa  79.7  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  22.77 
 
 		 602 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0482  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.64 
 
 		 579 aa  79  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.94 
 
 		 567 aa  78.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.93 
 
 		 592 aa  78.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.21 
 
 		 554 aa  76.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1655  hypothetical protein  25.19 
 
 		 588 aa  75.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.28 
 
 		 590 aa  72.4  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.05 
 
 		 586 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.29 
 
 		 596 aa  70.5  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  24.29 
 
 		 596 aa  70.5  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.21 
 
 		 593 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  24.14 
 
 		 531 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.05 
 
 		 594 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  24.29 
 
 		 596 aa  68.9  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2219  hemolysin activation/secretion protein  30.77 
 
 		 575 aa  68.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0458384  normal  0.400148 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>