214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1533 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  100 
 
 		 692 aa  1389    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  45.91 
 
 		 585 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  42.78 
 
 		 587 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  38.6 
 
 		 588 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  37.5 
 
 		 585 aa  369  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  40.31 
 
 		 584 aa  360  4e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  36.88 
 
 		 608 aa  317  6e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  35.12 
 
 		 595 aa  307  5.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  35.86 
 
 		 595 aa  303  7.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.35 
 
 		 1349 aa  303  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.16 
 
 		 1391 aa  300  6e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.11 
 
 		 1570 aa  299  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  34.44 
 
 		 568 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  36.22 
 
 		 580 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  34.64 
 
 		 568 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.53 
 
 		 639 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.53 
 
 		 584 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5478  surface antigen (D15)  29.93 
 
 		 579 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  26.81 
 
 		 558 aa  165  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5639  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.81 
 
 		 533 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000755047 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  26.74 
 
 		 553 aa  150  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.92 
 
 		 567 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  26.52 
 
 		 550 aa  144  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.82 
 
 		 569 aa  126  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.09 
 
 		 554 aa  124  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.46 
 
 		 561 aa  123  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  25.38 
 
 		 607 aa  120  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.18 
 
 		 583 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.44 
 
 		 546 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.47 
 
 		 585 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.75 
 
 		 572 aa  113  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.56 
 
 		 692 aa  113  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  25 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.55 
 
 		 567 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.09 
 
 		 586 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  25.42 
 
 		 568 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  25.24 
 
 		 568 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  25.1 
 
 		 556 aa  103  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  22.99 
 
 		 555 aa  101  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.58 
 
 		 573 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.24 
 
 		 543 aa  101  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  25.05 
 
 		 599 aa  100  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.19 
 
 		 554 aa  99.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.29 
 
 		 568 aa  98.6  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  24.28 
 
 		 596 aa  98.2  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.28 
 
 		 596 aa  98.2  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.2 
 
 		 747 aa  97.8  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  24.28 
 
 		 596 aa  95.5  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.17 
 
 		 578 aa  95.1  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.09 
 
 		 561 aa  93.6  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.49 
 
 		 541 aa  90.9  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  23.99 
 
 		 550 aa  90.9  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.07 
 
 		 559 aa  89.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1630  surface antigen variable number  39.31 
 
 		 143 aa  88.6  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.479161  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.02 
 
 		 538 aa  87  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  24.55 
 
 		 575 aa  85.9  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  22.49 
 
 		 569 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  23.44 
 
 		 567 aa  85.1  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  23.44 
 
 		 567 aa  85.1  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  23.44 
 
 		 567 aa  85.1  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.87 
 
 		 595 aa  84.3  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  21.65 
 
 		 547 aa  84  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.33 
 
 		 590 aa  82.8  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.13 
 
 		 554 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  22.18 
 
 		 548 aa  82.4  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.7 
 
 		 592 aa  81.6  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.13 
 
 		 554 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  24.35 
 
 		 574 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2226  hypothetical protein  22.04 
 
 		 543 aa  80.9  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.933636  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.12 
 
 		 558 aa  80.5  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  22.16 
 
 		 583 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.06 
 
 		 608 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  23.55 
 
 		 545 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  20.5 
 
 		 597 aa  78.2  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0354  hemolysin activation/secretion protein  23.29 
 
 		 555 aa  77.4  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0188948 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.64 
 
 		 571 aa  77.8  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  21.98 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.15 
 
 		 560 aa  77  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  22.32 
 
 		 544 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  23.48 
 
 		 562 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  24.11 
 
 		 565 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  24.17 
 
 		 562 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  24.17 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  22.45 
 
 		 558 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  22.27 
 
 		 531 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  21.23 
 
 		 583 aa  73.9  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.59 
 
 		 575 aa  73.9  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.33 
 
 		 585 aa  72.8  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  23.51 
 
 		 893 aa  72  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  22.89 
 
 		 576 aa  71.6  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.53 
 
 		 574 aa  71.6  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  21.23 
 
 		 602 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  21.9 
 
 		 544 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  21.68 
 
 		 582 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.33 
 
 		 554 aa  70.1  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0300  hemolysin activator protein  22.63 
 
 		 562 aa  68.2  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00625551  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  21.88 
 
 		 508 aa  68.2  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  22.09 
 
 		 581 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.99 
 
 		 557 aa  67  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  24.89 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>