106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2226 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2226  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1117    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.933636  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2576  hemolysin activation/secretion protein  44.27 
 
 		 537 aa  388  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0354  hemolysin activation/secretion protein  41.2 
 
 		 555 aa  381  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0188948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  41.74 
 
 		 547 aa  378  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  41.19 
 
 		 590 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2921  hemolysin activation/secretion protein  38.43 
 
 		 593 aa  339  7e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.502908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  38.48 
 
 		 544 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.6 
 
 		 543 aa  331  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2219  hemolysin activation/secretion protein  37.62 
 
 		 575 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0458384  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  37.6 
 
 		 550 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  37.82 
 
 		 544 aa  325  9e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  37.72 
 
 		 531 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  38.69 
 
 		 555 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.43 
 
 		 538 aa  315  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  34.49 
 
 		 541 aa  287  4e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.72 
 
 		 538 aa  211  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.41 
 
 		 576 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  26.53 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  25.43 
 
 		 608 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  23.57 
 
 		 595 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  24.05 
 
 		 584 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.49 
 
 		 584 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.29 
 
 		 639 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.91 
 
 		 580 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  25.44 
 
 		 585 aa  91.3  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  24.77 
 
 		 588 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.85 
 
 		 1570 aa  87.4  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.54 
 
 		 1391 aa  86.7  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.03 
 
 		 747 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.24 
 
 		 1349 aa  84.7  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  24.2 
 
 		 568 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  22.04 
 
 		 692 aa  80.9  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  24.2 
 
 		 568 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.84 
 
 		 585 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  23.5 
 
 		 553 aa  76.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  25.37 
 
 		 582 aa  73.6  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  23.59 
 
 		 558 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.08 
 
 		 567 aa  70.5  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  23.48 
 
 		 554 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  27.27 
 
 		 607 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.92 
 
 		 561 aa  66.2  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.33 
 
 		 585 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.58 
 
 		 560 aa  61.6  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.45 
 
 		 567 aa  61.6  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.12 
 
 		 572 aa  61.6  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  23.33 
 
 		 548 aa  60.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  23.14 
 
 		 587 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  25.37 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.51 
 
 		 571 aa  58.9  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  25.37 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  23.37 
 
 		 555 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.87 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25 
 
 		 583 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.03 
 
 		 569 aa  57.8  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.65 
 
 		 557 aa  57.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.42 
 
 		 554 aa  57.4  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.51 
 
 		 610 aa  57  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.35 
 
 		 558 aa  56.6  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.69 
 
 		 554 aa  56.2  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22 
 
 		 565 aa  55.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  25.43 
 
 		 583 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  24.19 
 
 		 583 aa  53.5  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  20.3 
 
 		 550 aa  53.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  30.3 
 
 		 599 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.17 
 
 		 573 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.2 
 
 		 546 aa  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.8 
 
 		 575 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.63 
 
 		 568 aa  51.6  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28 
 
 		 559 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  30.15 
 
 		 595 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.33 
 
 		 585 aa  51.2  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  21.09 
 
 		 558 aa  50.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  24.44 
 
 		 562 aa  50.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.44 
 
 		 562 aa  50.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.12 
 
 		 569 aa  50.4  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  23.81 
 
 		 562 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  27.86 
 
 		 569 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.38 
 
 		 561 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.38 
 
 		 561 aa  48.5  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  23.59 
 
 		 562 aa  48.5  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  25.77 
 
 		 561 aa  48.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.59 
 
 		 562 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  20.45 
 
 		 596 aa  47.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.45 
 
 		 596 aa  47.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.7 
 
 		 692 aa  47.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.77 
 
 		 561 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  28.5 
 
 		 581 aa  47  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  25.15 
 
 		 561 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.28 
 
 		 561 aa  47  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.15 
 
 		 561 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.7 
 
 		 560 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1436  outer envelope membrane protein-like  29.76 
 
 		 712 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  26.39 
 
 		 584 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  20.45 
 
 		 596 aa  45.8  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.66 
 
 		 559 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.15 
 
 		 561 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  28.03 
 
 		 587 aa  45.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5639  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.86 
 
 		 533 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000755047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.62 
 
 		 586 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  26.09 
 
 		 597 aa  43.9  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>