201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4182 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  100 
 
 
608 aa  1225    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  58.8 
 
 
595 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  54.53 
 
 
588 aa  592  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  53.62 
 
 
585 aa  572  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  51.12 
 
 
595 aa  472  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  48.46 
 
 
568 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  48.65 
 
 
568 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  47.35 
 
 
580 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.59 
 
 
1570 aa  444  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.47 
 
 
1349 aa  439  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.84 
 
 
1391 aa  441  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  45.88 
 
 
584 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  46.12 
 
 
639 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  46.32 
 
 
584 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  37 
 
 
692 aa  339  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  34.25 
 
 
585 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  32.22 
 
 
587 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5478  surface antigen (D15)  31.05 
 
 
579 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492721 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5639  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.23 
 
 
533 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000755047 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  25.54 
 
 
558 aa  146  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.39 
 
 
747 aa  130  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1630  surface antigen variable number  47.86 
 
 
143 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.479161  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.95 
 
 
561 aa  120  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.21 
 
 
567 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.54 
 
 
546 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2226  hypothetical protein  25.79 
 
 
543 aa  114  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.933636  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.92 
 
 
583 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  25.91 
 
 
553 aa  114  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.95 
 
 
561 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  26.01 
 
 
607 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.73 
 
 
572 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.5 
 
 
541 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.95 
 
 
692 aa  107  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  25.19 
 
 
583 aa  106  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  25.24 
 
 
583 aa  105  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  25.54 
 
 
582 aa  105  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  25.05 
 
 
531 aa  104  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  23.67 
 
 
544 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.77 
 
 
585 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  24.06 
 
 
544 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  24.37 
 
 
554 aa  102  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  25.18 
 
 
550 aa  99.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  24.89 
 
 
590 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.64 
 
 
596 aa  97.4  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  24.64 
 
 
596 aa  97.4  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.88 
 
 
558 aa  97.1  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  26.32 
 
 
550 aa  96.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.92 
 
 
608 aa  96.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.1 
 
 
543 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.55 
 
 
575 aa  96.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.89 
 
 
554 aa  95.9  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  24.64 
 
 
596 aa  95.1  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  23.92 
 
 
547 aa  94  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.65 
 
 
585 aa  94  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.35 
 
 
573 aa  93.6  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.58 
 
 
586 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.39 
 
 
569 aa  90.5  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.48 
 
 
567 aa  89.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.38 
 
 
576 aa  88.6  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  25.9 
 
 
574 aa  87  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  23.58 
 
 
442 aa  87  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0354  hemolysin activation/secretion protein  24.75 
 
 
555 aa  87  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0188948 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.85 
 
 
560 aa  87  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.12 
 
 
538 aa  86.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  25.46 
 
 
581 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.62 
 
 
554 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.93 
 
 
554 aa  85.1  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  23.28 
 
 
555 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.03 
 
 
554 aa  84.7  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.28 
 
 
592 aa  84.7  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.31 
 
 
549 aa  84.3  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.4 
 
 
554 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.16 
 
 
538 aa  82  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.38 
 
 
580 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  21.5 
 
 
567 aa  80.9  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  21.5 
 
 
567 aa  80.9  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  24.77 
 
 
599 aa  80.5  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  22.67 
 
 
558 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  21.5 
 
 
567 aa  80.1  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  22.81 
 
 
531 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.74 
 
 
557 aa  78.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.44 
 
 
578 aa  78.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  22.03 
 
 
602 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.53 
 
 
568 aa  78.2  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.25 
 
 
571 aa  76.6  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0300  hemolysin activator protein  23.44 
 
 
562 aa  75.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00625551  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4591  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.39 
 
 
552 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0179388 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  23.51 
 
 
587 aa  74.7  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  27.83 
 
 
558 aa  73.9  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  23.8 
 
 
569 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.18 
 
 
559 aa  73.9  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2576  hemolysin activation/secretion protein  23.12 
 
 
537 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  24.11 
 
 
556 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  23.24 
 
 
568 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  23.24 
 
 
568 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.11 
 
 
553 aa  71.2  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  24.63 
 
 
548 aa  70.9  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.75 
 
 
597 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.13 
 
 
565 aa  70.5  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.43 
 
 
610 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>