93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1989 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  100 
 
 		 587 aa  1179    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3190  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  49.73 
 
 		 589 aa  515  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  45.99 
 
 		 607 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2383  hemolysin activation/secretion protein-like  44.15 
 
 		 624 aa  441  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418836  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.2 
 
 		 561 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26 
 
 		 561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  26.2 
 
 		 561 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.2 
 
 		 561 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  25.6 
 
 		 561 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.34 
 
 		 561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.1 
 
 		 561 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  28.54 
 
 		 568 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  28.21 
 
 		 568 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.41 
 
 		 559 aa  104  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  25.7 
 
 		 551 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  25.5 
 
 		 551 aa  101  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  25.5 
 
 		 551 aa  101  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  25.5 
 
 		 551 aa  101  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  25.2 
 
 		 559 aa  101  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  25.15 
 
 		 597 aa  100  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  25.2 
 
 		 559 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  25.2 
 
 		 551 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.41 
 
 		 569 aa  97.8  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  23.78 
 
 		 569 aa  95.1  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2095  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.48 
 
 		 592 aa  89.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  23.98 
 
 		 555 aa  89.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  24.01 
 
 		 595 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  25.43 
 
 		 599 aa  82  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  26.06 
 
 		 548 aa  81.3  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  23.59 
 
 		 558 aa  80.5  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.02 
 
 		 560 aa  80.5  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.09 
 
 		 569 aa  78.2  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  22.81 
 
 		 557 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0482  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.32 
 
 		 579 aa  75.5  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.05 
 
 		 581 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.08 
 
 		 576 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.05 
 
 		 581 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  23.23 
 
 		 565 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2460  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.72 
 
 		 587 aa  70.9  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118018  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  24.79 
 
 		 608 aa  70.5  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  23.6 
 
 		 554 aa  69.3  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  26.11 
 
 		 550 aa  68.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.33 
 
 		 548 aa  67.8  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.17 
 
 		 538 aa  67.8  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.6 
 
 		 572 aa  66.6  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  23.75 
 
 		 574 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  23.28 
 
 		 558 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  25.05 
 
 		 595 aa  64.3  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.38 
 
 		 747 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0147  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.5 
 
 		 572 aa  62  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.04 
 
 		 553 aa  62  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.31 
 
 		 578 aa  62  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  23.59 
 
 		 584 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.27 
 
 		 585 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  22.84 
 
 		 1570 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.52 
 
 		 639 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.71 
 
 		 586 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  22.13 
 
 		 531 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  23.83 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  28.47 
 
 		 607 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.26 
 
 		 554 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  26.75 
 
 		 553 aa  57.4  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.55 
 
 		 541 aa  57  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  20.78 
 
 		 588 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.8 
 
 		 584 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.24 
 
 		 585 aa  56.6  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.81 
 
 		 554 aa  55.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  23.99 
 
 		 568 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  22.22 
 
 		 1391 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.46 
 
 		 554 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  21.35 
 
 		 585 aa  54.7  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4591  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.33 
 
 		 552 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0179388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  37.62 
 
 		 545 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  22.03 
 
 		 1349 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.25 
 
 		 554 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  22.17 
 
 		 544 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  27.14 
 
 		 576 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  32.71 
 
 		 555 aa  52  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  32.71 
 
 		 531 aa  52  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  23.8 
 
 		 568 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  23.2 
 
 		 692 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.55 
 
 		 538 aa  51.2  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.25 
 
 		 561 aa  50.8  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.41 
 
 		 561 aa  50.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  22.12 
 
 		 544 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  25.64 
 
 		 576 aa  48.5  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5639  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.5 
 
 		 533 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000755047 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32 
 
 		 568 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.63 
 
 		 543 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.69 
 
 		 567 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  28.57 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2226  hypothetical protein  28.03 
 
 		 543 aa  45.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.933636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  23.99 
 
 		 558 aa  45.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>