130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1457 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  100 
 
 		 555 aa  1142    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  54.67 
 
 		 543 aa  570  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2576  hemolysin activation/secretion protein  37.88 
 
 		 537 aa  345  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0354  hemolysin activation/secretion protein  37.92 
 
 		 555 aa  342  1e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0188948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  36.35 
 
 		 547 aa  341  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2226  hypothetical protein  38.55 
 
 		 543 aa  330  3e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.933636  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  34.38 
 
 		 590 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2219  hemolysin activation/secretion protein  35.11 
 
 		 575 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0458384  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.3 
 
 		 538 aa  296  6e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2921  hemolysin activation/secretion protein  33.15 
 
 		 593 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.502908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  32.27 
 
 		 550 aa  266  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.08 
 
 		 541 aa  249  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  31.46 
 
 		 531 aa  243  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  32.28 
 
 		 544 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  30.84 
 
 		 544 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.12 
 
 		 538 aa  222  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.91 
 
 		 576 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  26.75 
 
 		 531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  22.99 
 
 		 692 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  24.41 
 
 		 558 aa  98.6  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  23.28 
 
 		 553 aa  94.4  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.76 
 
 		 567 aa  93.2  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  22.87 
 
 		 585 aa  90.9  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  23.39 
 
 		 548 aa  90.5  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.39 
 
 		 572 aa  88.6  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  20.28 
 
 		 554 aa  88.2  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  23.71 
 
 		 588 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  23.43 
 
 		 607 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.2 
 
 		 1391 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.38 
 
 		 554 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  21.27 
 
 		 584 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.4 
 
 		 578 aa  82.4  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.05 
 
 		 571 aa  80.1  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.59 
 
 		 561 aa  79.7  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  24.36 
 
 		 582 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.99 
 
 		 567 aa  78.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.68 
 
 		 1349 aa  78.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.73 
 
 		 1570 aa  77.8  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.72 
 
 		 747 aa  77.8  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  23.6 
 
 		 570 aa  75.1  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.79 
 
 		 610 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  23.96 
 
 		 550 aa  74.3  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  23.55 
 
 		 583 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.15 
 
 		 561 aa  73.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  24.52 
 
 		 568 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  23.74 
 
 		 583 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.67 
 
 		 583 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.34 
 
 		 569 aa  72.4  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.61 
 
 		 554 aa  72.8  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  23.69 
 
 		 568 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.15 
 
 		 569 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  23.2 
 
 		 587 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.88 
 
 		 597 aa  72  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.54 
 
 		 565 aa  70.5  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  23.15 
 
 		 569 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.06 
 
 		 586 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.13 
 
 		 585 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.07 
 
 		 585 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.94 
 
 		 608 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.77 
 
 		 558 aa  67  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.49 
 
 		 554 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.21 
 
 		 580 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  21.96 
 
 		 562 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  22.28 
 
 		 562 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  21.96 
 
 		 562 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  29.71 
 
 		 568 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  29.71 
 
 		 568 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  19.91 
 
 		 692 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.63 
 
 		 545 aa  63.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  22.41 
 
 		 565 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.87 
 
 		 592 aa  62  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  18.78 
 
 		 554 aa  61.2  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  24.89 
 
 		 595 aa  60.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.04 
 
 		 580 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  33.93 
 
 		 608 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  34.88 
 
 		 584 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4497  surface antigen (D15)  23.35 
 
 		 688 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537472  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  30.43 
 
 		 556 aa  57  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  31.76 
 
 		 561 aa  57  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.86 
 
 		 546 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.33 
 
 		 639 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  29.32 
 
 		 599 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  27.54 
 
 		 595 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.88 
 
 		 561 aa  54.7  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.22 
 
 		 573 aa  54.7  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3190  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.86 
 
 		 589 aa  54.7  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.08 
 
 		 561 aa  53.9  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  31.91 
 
 		 559 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  31.91 
 
 		 559 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  31.91 
 
 		 551 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  31.91 
 
 		 551 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  31.91 
 
 		 551 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  31.91 
 
 		 551 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  31.91 
 
 		 551 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  20.68 
 
 		 569 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30 
 
 		 575 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  30.99 
 
 		 597 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  32.71 
 
 		 587 aa  52  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  30.41 
 
 		 561 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.41 
 
 		 561 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>