137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2200 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  100 
 
 
541 aa  1100    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  53.59 
 
 
531 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  52.77 
 
 
544 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  51.31 
 
 
544 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  42.66 
 
 
550 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.55 
 
 
538 aa  346  6e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2219  hemolysin activation/secretion protein  36.66 
 
 
575 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0458384  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  37.79 
 
 
547 aa  325  9e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0354  hemolysin activation/secretion protein  39.05 
 
 
555 aa  323  5e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0188948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2921  hemolysin activation/secretion protein  33.77 
 
 
593 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.502908  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  37.25 
 
 
590 aa  320  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2576  hemolysin activation/secretion protein  36.79 
 
 
537 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2226  hypothetical protein  33.94 
 
 
543 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.933636  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.55 
 
 
543 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  30.46 
 
 
555 aa  250  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.82 
 
 
538 aa  205  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.59 
 
 
747 aa  124  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.24 
 
 
576 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  26.05 
 
 
531 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  23.05 
 
 
588 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  23.51 
 
 
608 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  22.48 
 
 
585 aa  98.2  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  24.9 
 
 
558 aa  97.1  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  23.44 
 
 
692 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.18 
 
 
1391 aa  94.4  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  23.25 
 
 
595 aa  94  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.06 
 
 
1570 aa  91.3  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.35 
 
 
1349 aa  90.9  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  23.76 
 
 
595 aa  90.5  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  24.81 
 
 
584 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.6 
 
 
567 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  22.08 
 
 
568 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.37 
 
 
580 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  23.15 
 
 
553 aa  78.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.16 
 
 
584 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.77 
 
 
639 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.71 
 
 
567 aa  77.4  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  23.46 
 
 
607 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  21.89 
 
 
568 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  23.81 
 
 
548 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.52 
 
 
585 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  24.13 
 
 
555 aa  72  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  23.55 
 
 
561 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.9 
 
 
692 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.71 
 
 
561 aa  66.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.94 
 
 
583 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.35 
 
 
561 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.71 
 
 
559 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.75 
 
 
573 aa  66.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  23.97 
 
 
599 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.06 
 
 
586 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.32 
 
 
572 aa  65.1  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.71 
 
 
558 aa  65.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.75 
 
 
561 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.27 
 
 
553 aa  64.3  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.32 
 
 
585 aa  63.9  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  23.7 
 
 
597 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  23.24 
 
 
561 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.24 
 
 
561 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.85 
 
 
561 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.85 
 
 
561 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.13 
 
 
546 aa  60.1  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  20.77 
 
 
587 aa  59.7  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  23.37 
 
 
559 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  24.47 
 
 
582 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  25.71 
 
 
568 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  23.37 
 
 
559 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.64 
 
 
585 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  25.71 
 
 
568 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  23.37 
 
 
551 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  23.37 
 
 
551 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2342  HlyB family hemolysin activator protein  30.73 
 
 
554 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  23.37 
 
 
551 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.12 
 
 
578 aa  58.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  23.59 
 
 
545 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  23.37 
 
 
551 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  23.18 
 
 
551 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.1 
 
 
561 aa  57.8  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1757  HlyB family hemolysin activator protein  30.21 
 
 
520 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.598538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.15 
 
 
554 aa  57  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  21.49 
 
 
554 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  30.21 
 
 
551 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  30.21 
 
 
558 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  21.4 
 
 
508 aa  57  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  30.21 
 
 
554 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  30.21 
 
 
558 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.87 
 
 
549 aa  56.2  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  21.07 
 
 
587 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  21.55 
 
 
558 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.23 
 
 
571 aa  55.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.97 
 
 
568 aa  55.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.19 
 
 
565 aa  55.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.77 
 
 
569 aa  54.7  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  30.21 
 
 
554 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  22.06 
 
 
575 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1655  hypothetical protein  22.18 
 
 
588 aa  53.5  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5478  surface antigen (D15)  20.34 
 
 
579 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.1 
 
 
554 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  21.86 
 
 
551 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  21.86 
 
 
551 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>