111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2219 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2219  hemolysin activation/secretion protein  100 
 
 		 575 aa  1177    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0458384  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2921  hemolysin activation/secretion protein  70.83 
 
 		 593 aa  865    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.502908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  56.3 
 
 		 590 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  43.48 
 
 		 550 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2576  hemolysin activation/secretion protein  42.74 
 
 		 537 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  41.01 
 
 		 538 aa  392  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  41.48 
 
 		 547 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0354  hemolysin activation/secretion protein  40.11 
 
 		 555 aa  378  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0188948 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2226  hypothetical protein  38.94 
 
 		 543 aa  354  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.933636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  36.94 
 
 		 544 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  37.8 
 
 		 531 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.52 
 
 		 543 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  37.52 
 
 		 544 aa  336  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  36.97 
 
 		 541 aa  336  7e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  35.92 
 
 		 555 aa  317  5e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.67 
 
 		 538 aa  192  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.07 
 
 		 576 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.69 
 
 		 747 aa  112  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  26.61 
 
 		 531 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  23.11 
 
 		 553 aa  90.5  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  22.45 
 
 		 554 aa  87  8e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.16 
 
 		 571 aa  86.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  22.99 
 
 		 558 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.12 
 
 		 1391 aa  78.2  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.12 
 
 		 1349 aa  77.8  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.12 
 
 		 1570 aa  77.4  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.99 
 
 		 567 aa  77.4  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.95 
 
 		 554 aa  75.5  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  23.26 
 
 		 588 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  23.44 
 
 		 569 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  25.11 
 
 		 607 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.51 
 
 		 573 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.19 
 
 		 610 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.09 
 
 		 554 aa  68.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  22.22 
 
 		 584 aa  68.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  30.77 
 
 		 599 aa  68.2  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  24.88 
 
 		 608 aa  67.4  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.59 
 
 		 572 aa  67.4  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.86 
 
 		 575 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  20.61 
 
 		 585 aa  65.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.68 
 
 		 692 aa  65.1  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.94 
 
 		 560 aa  65.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  23.02 
 
 		 548 aa  64.7  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.15 
 
 		 554 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  21.75 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.51 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  23.26 
 
 		 582 aa  60.8  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.32 
 
 		 578 aa  60.8  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  23.34 
 
 		 583 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  20 
 
 		 550 aa  59.7  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  23.34 
 
 		 583 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.21 
 
 		 608 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.58 
 
 		 592 aa  58.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.08 
 
 		 557 aa  58.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  20.45 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.45 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.22 
 
 		 580 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.06 
 
 		 585 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  23.35 
 
 		 562 aa  57  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  23.35 
 
 		 562 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.58 
 
 		 565 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  20.45 
 
 		 596 aa  56.6  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  23.26 
 
 		 570 aa  55.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  24.94 
 
 		 558 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.22 
 
 		 567 aa  54.3  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  21.13 
 
 		 692 aa  53.9  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.52 
 
 		 585 aa  53.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  21.01 
 
 		 576 aa  52.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.19 
 
 		 560 aa  52.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.8 
 
 		 553 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.09 
 
 		 597 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.24 
 
 		 546 aa  51.2  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  24 
 
 		 557 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.81 
 
 		 586 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  22.66 
 
 		 562 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.28 
 
 		 580 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.18 
 
 		 581 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.18 
 
 		 581 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  22.65 
 
 		 602 aa  48.9  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  50 
 
 		 584 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20 
 
 		 568 aa  48.5  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  50 
 
 		 639 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.86 
 
 		 549 aa  48.5  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  22.37 
 
 		 586 aa  47.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  22.66 
 
 		 562 aa  47.8  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.66 
 
 		 562 aa  47.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.72 
 
 		 561 aa  47.4  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1757  HlyB family hemolysin activator protein  25.27 
 
 		 520 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.598538  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  20 
 
 		 576 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  25.27 
 
 		 558 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  25.27 
 
 		 554 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  25.27 
 
 		 558 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.95 
 
 		 559 aa  47  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.07 
 
 		 561 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  19.58 
 
 		 580 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  22 
 
 		 586 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  20.81 
 
 		 562 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  20.81 
 
 		 565 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  20.16 
 
 		 545 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  20.19 
 
 		 508 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>