125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2993 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2921  hemolysin activation/secretion protein  60.22 
 
 		 593 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.502908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  100 
 
 		 590 aa  1201    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2219  hemolysin activation/secretion protein  56.13 
 
 		 575 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0458384  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2576  hemolysin activation/secretion protein  46.82 
 
 		 537 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  42.35 
 
 		 550 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0354  hemolysin activation/secretion protein  44.6 
 
 		 555 aa  391  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0188948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  42.11 
 
 		 538 aa  391  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2226  hypothetical protein  41.19 
 
 		 543 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.933636  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  42.86 
 
 		 547 aa  371  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  39.25 
 
 		 544 aa  352  8e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  40.59 
 
 		 531 aa  352  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  38.68 
 
 		 544 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  39.25 
 
 		 543 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  37.06 
 
 		 541 aa  313  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  35.58 
 
 		 555 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.06 
 
 		 538 aa  201  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.5 
 
 		 576 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.3 
 
 		 747 aa  121  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  27.31 
 
 		 531 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.42 
 
 		 572 aa  97.8  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.58 
 
 		 1391 aa  97.1  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.39 
 
 		 1349 aa  95.5  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  24.54 
 
 		 608 aa  94.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.29 
 
 		 1570 aa  88.6  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  24.71 
 
 		 584 aa  86.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  22.99 
 
 		 553 aa  84.7  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  23.73 
 
 		 599 aa  84.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  24.23 
 
 		 554 aa  81.6  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  23.96 
 
 		 550 aa  81.6  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.71 
 
 		 545 aa  79.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  24.66 
 
 		 585 aa  78.6  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  22.94 
 
 		 548 aa  76.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.12 
 
 		 554 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.91 
 
 		 571 aa  76.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.36 
 
 		 567 aa  73.6  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.7 
 
 		 567 aa  72.8  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  23.4 
 
 		 588 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  22.2 
 
 		 595 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.42 
 
 		 578 aa  69.7  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.32 
 
 		 554 aa  70.1  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.51 
 
 		 584 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.42 
 
 		 557 aa  69.3  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.27 
 
 		 639 aa  67.8  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  24.64 
 
 		 607 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.05 
 
 		 585 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  22.78 
 
 		 582 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.49 
 
 		 583 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.84 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  23.2 
 
 		 568 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  29.86 
 
 		 570 aa  63.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.86 
 
 		 592 aa  63.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.27 
 
 		 554 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.8 
 
 		 573 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  23.51 
 
 		 568 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.51 
 
 		 560 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.13 
 
 		 561 aa  62.4  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  24.62 
 
 		 569 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  24.89 
 
 		 562 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.22 
 
 		 585 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  24.57 
 
 		 559 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  24.57 
 
 		 551 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  24.57 
 
 		 551 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  24.57 
 
 		 551 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  24.89 
 
 		 562 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  24.39 
 
 		 597 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.99 
 
 		 608 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  24.39 
 
 		 551 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.12 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  24.39 
 
 		 559 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  24.88 
 
 		 557 aa  57.4  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.01 
 
 		 581 aa  57  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.28 
 
 		 565 aa  57  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.01 
 
 		 581 aa  57  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  24.2 
 
 		 551 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.11 
 
 		 558 aa  56.2  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.52 
 
 		 546 aa  55.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.1 
 
 		 610 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  25.5 
 
 		 558 aa  54.7  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.16 
 
 		 575 aa  54.7  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.31 
 
 		 569 aa  54.7  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  24.08 
 
 		 569 aa  54.3  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.36 
 
 		 559 aa  53.9  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  23.45 
 
 		 583 aa  53.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  21.51 
 
 		 692 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.28 
 
 		 553 aa  53.5  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  22.01 
 
 		 602 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.51 
 
 		 580 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.28 
 
 		 580 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  22.74 
 
 		 442 aa  52  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.57 
 
 		 561 aa  52.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.42 
 
 		 569 aa  51.6  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.28 
 
 		 597 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  23.28 
 
 		 583 aa  50.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  22.27 
 
 		 576 aa  50.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  28.36 
 
 		 562 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.25 
 
 		 560 aa  51.2  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  28.36 
 
 		 565 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  21.99 
 
 		 558 aa  50.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  22.43 
 
 		 576 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  20.24 
 
 		 567 aa  50.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>