173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5860 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  76.39 
 
 
531 aa  796    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 
576 aa  1169    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.41 
 
 
538 aa  155  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  26.91 
 
 
555 aa  144  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  27.25 
 
 
544 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  27.41 
 
 
544 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  27.35 
 
 
531 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.23 
 
 
543 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2226  hypothetical protein  27.41 
 
 
543 aa  124  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.933636  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  27.5 
 
 
590 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  26.36 
 
 
547 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.7 
 
 
541 aa  113  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  23.21 
 
 
584 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2219  hemolysin activation/secretion protein  26.07 
 
 
575 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0458384  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2921  hemolysin activation/secretion protein  24.68 
 
 
593 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.502908  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.69 
 
 
538 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  25.81 
 
 
550 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2576  hemolysin activation/secretion protein  25.46 
 
 
537 aa  108  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0354  hemolysin activation/secretion protein  25.39 
 
 
555 aa  105  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0188948 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  24.65 
 
 
588 aa  93.6  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.19 
 
 
583 aa  93.6  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.79 
 
 
1570 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  24.43 
 
 
553 aa  89  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  22.18 
 
 
585 aa  89.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.79 
 
 
1391 aa  88.2  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2383  hemolysin activation/secretion protein-like  25.65 
 
 
624 aa  86.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418836  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  22.81 
 
 
1349 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.27 
 
 
747 aa  85.5  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  23.74 
 
 
558 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.57 
 
 
554 aa  84.7  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.97 
 
 
585 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  24.9 
 
 
551 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  23.96 
 
 
569 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  24.61 
 
 
597 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  24.71 
 
 
559 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.11 
 
 
585 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  24.71 
 
 
551 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  24.71 
 
 
551 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  24.71 
 
 
551 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  24.71 
 
 
551 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  24.71 
 
 
559 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  23.9 
 
 
568 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.81 
 
 
585 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  24.89 
 
 
607 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.81 
 
 
569 aa  79  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.51 
 
 
568 aa  79.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  24.89 
 
 
548 aa  78.2  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  24.18 
 
 
608 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  23.74 
 
 
561 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  24.87 
 
 
568 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  25.31 
 
 
562 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  25.31 
 
 
562 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.98 
 
 
573 aa  76.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  25.1 
 
 
578 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.91 
 
 
561 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  24.7 
 
 
568 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  23.9 
 
 
568 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.42 
 
 
554 aa  73.9  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.37 
 
 
567 aa  73.9  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.01 
 
 
546 aa  73.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.56 
 
 
561 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  27.08 
 
 
587 aa  72.4  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  22.76 
 
 
561 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.35 
 
 
561 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.76 
 
 
561 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.04 
 
 
567 aa  72.8  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.35 
 
 
561 aa  72  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  24.75 
 
 
562 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3190  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.5 
 
 
589 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376319  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  24.75 
 
 
565 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  22.37 
 
 
586 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  22.37 
 
 
586 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.71 
 
 
561 aa  70.5  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.11 
 
 
580 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  25.73 
 
 
550 aa  68.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  23.68 
 
 
568 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  24.21 
 
 
585 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  25.15 
 
 
585 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  23.91 
 
 
583 aa  67  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.76 
 
 
575 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  24.18 
 
 
545 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.7 
 
 
584 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.64 
 
 
569 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  24.6 
 
 
583 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  24.06 
 
 
561 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  37.93 
 
 
607 aa  65.1  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.24 
 
 
572 aa  64.7  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  25.09 
 
 
556 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  21.84 
 
 
555 aa  64.7  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.22 
 
 
597 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.46 
 
 
578 aa  63.5  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  24.02 
 
 
595 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.16 
 
 
558 aa  63.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.79 
 
 
580 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.79 
 
 
582 aa  62.4  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.88 
 
 
586 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.54 
 
 
586 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.06 
 
 
584 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.22 
 
 
549 aa  60.1  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  21.85 
 
 
569 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.142644 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>