178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1094 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 
571 aa  1150    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0771  polypeptide-transport-associated domain protein, ShlB-type  57.19 
 
 
310 aa  335  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.891277 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.21 
 
 
567 aa  278  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  31.03 
 
 
550 aa  229  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  31.2 
 
 
553 aa  225  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  30.95 
 
 
607 aa  206  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  32.53 
 
 
554 aa  204  4e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  28.62 
 
 
576 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  29.5 
 
 
576 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.96 
 
 
554 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.24 
 
 
592 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.7 
 
 
692 aa  191  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.04 
 
 
572 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.71 
 
 
585 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.94 
 
 
583 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.33 
 
 
554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  28.49 
 
 
548 aa  172  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.23 
 
 
586 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  28.72 
 
 
545 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.89 
 
 
561 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.16 
 
 
578 aa  148  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.02 
 
 
569 aa  137  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.56 
 
 
596 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  25.56 
 
 
596 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  25.56 
 
 
596 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  28.81 
 
 
567 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  28.62 
 
 
567 aa  134  6.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  28.62 
 
 
567 aa  134  6.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  26.42 
 
 
556 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.24 
 
 
546 aa  110  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.55 
 
 
595 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  24.59 
 
 
575 aa  104  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.29 
 
 
590 aa  103  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  24.95 
 
 
442 aa  99.4  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  24.91 
 
 
581 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  23.79 
 
 
558 aa  95.9  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.44 
 
 
545 aa  94.7  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.79 
 
 
747 aa  92.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  24.81 
 
 
599 aa  91.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.66 
 
 
574 aa  90.5  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.96 
 
 
567 aa  87.8  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.84 
 
 
561 aa  84.7  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.08 
 
 
585 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  22.96 
 
 
508 aa  83.6  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  22.71 
 
 
692 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.21 
 
 
543 aa  82  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  25.25 
 
 
551 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  25.25 
 
 
551 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  24.77 
 
 
531 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  23.19 
 
 
561 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  28.63 
 
 
569 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.44 
 
 
561 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2219  hemolysin activation/secretion protein  26.6 
 
 
575 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0458384  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.55 
 
 
569 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  23.14 
 
 
555 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  24.33 
 
 
544 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  25.91 
 
 
590 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  25.06 
 
 
544 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  24.66 
 
 
550 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2576  hemolysin activation/secretion protein  25.44 
 
 
537 aa  74.7  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  25.2 
 
 
547 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.74 
 
 
561 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  24.79 
 
 
558 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.74 
 
 
561 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  24.77 
 
 
568 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  22.46 
 
 
557 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  24.05 
 
 
555 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  24.29 
 
 
608 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  23.51 
 
 
569 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.65 
 
 
538 aa  72.8  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.92 
 
 
548 aa  71.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.66 
 
 
581 aa  70.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.66 
 
 
581 aa  70.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  22.35 
 
 
561 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.35 
 
 
561 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  24.15 
 
 
568 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  23.87 
 
 
585 aa  70.5  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.93 
 
 
549 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.63 
 
 
1391 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  25 
 
 
565 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  22.55 
 
 
551 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.22 
 
 
610 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.75 
 
 
560 aa  69.3  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  22.36 
 
 
559 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2921  hemolysin activation/secretion protein  22.59 
 
 
593 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.502908  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  24.53 
 
 
562 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  22.36 
 
 
551 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  22.36 
 
 
551 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  22.36 
 
 
551 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  22.36 
 
 
551 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  22.36 
 
 
559 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.63 
 
 
1349 aa  67.8  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.96 
 
 
561 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.91 
 
 
559 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  26.25 
 
 
588 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0055  hemolysin activation/secretion protein-like  23.61 
 
 
533 aa  66.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193341  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  20.83 
 
 
558 aa  65.1  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  22.87 
 
 
562 aa  64.7  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.39 
 
 
592 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.87 
 
 
562 aa  64.7  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>