219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1288 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  68.23 
 
 		 585 aa  694    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 		 583 aa  1185    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  64 
 
 		 607 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  54.37 
 
 		 586 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  46.01 
 
 		 545 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  44.78 
 
 		 550 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  46.27 
 
 		 553 aa  392  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  37.71 
 
 		 554 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.56 
 
 		 554 aa  288  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  39.31 
 
 		 554 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  35.14 
 
 		 556 aa  250  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.8 
 
 		 561 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  33.66 
 
 		 548 aa  243  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.2 
 
 		 569 aa  240  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  35.44 
 
 		 572 aa  234  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.12 
 
 		 578 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.4 
 
 		 567 aa  210  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.61 
 
 		 595 aa  210  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  29.43 
 
 		 567 aa  207  3e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  29.43 
 
 		 567 aa  207  3e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  29.43 
 
 		 567 aa  207  4e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31 
 
 		 592 aa  193  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  29.98 
 
 		 576 aa  187  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  28.9 
 
 		 596 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.9 
 
 		 596 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.21 
 
 		 747 aa  180  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.07 
 
 		 571 aa  179  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  28.9 
 
 		 596 aa  179  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  30.74 
 
 		 575 aa  178  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.88 
 
 		 590 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  31.31 
 
 		 442 aa  174  5e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  30.16 
 
 		 576 aa  173  9e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  30.99 
 
 		 581 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.2 
 
 		 692 aa  154  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.48 
 
 		 545 aa  151  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.15 
 
 		 574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  28.54 
 
 		 508 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  27.61 
 
 		 551 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  27.61 
 
 		 551 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  29.3 
 
 		 558 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.3 
 
 		 567 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  28.47 
 
 		 597 aa  124  6e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  27.18 
 
 		 692 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  25.5 
 
 		 568 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  25.3 
 
 		 568 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  27.24 
 
 		 588 aa  113  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  28.24 
 
 		 584 aa  110  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.98 
 
 		 546 aa  109  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  26.5 
 
 		 551 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  26.5 
 
 		 551 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  26.5 
 
 		 551 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  26.5 
 
 		 559 aa  107  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  26.99 
 
 		 608 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  26.32 
 
 		 559 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  26.32 
 
 		 551 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.33 
 
 		 585 aa  104  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  25.75 
 
 		 597 aa  104  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.79 
 
 		 559 aa  103  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  26.13 
 
 		 551 aa  104  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.14 
 
 		 561 aa  103  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.88 
 
 		 554 aa  103  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.92 
 
 		 561 aa  102  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  24.46 
 
 		 558 aa  101  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.21 
 
 		 560 aa  96.7  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  25.05 
 
 		 558 aa  96.3  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.54 
 
 		 561 aa  96.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.11 
 
 		 561 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.95 
 
 		 561 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  26.46 
 
 		 557 aa  95.1  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.94 
 
 		 558 aa  95.1  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  25.87 
 
 		 595 aa  94.4  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  23.96 
 
 		 561 aa  94  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.96 
 
 		 561 aa  94  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.19 
 
 		 576 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.29 
 
 		 563 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  25.91 
 
 		 599 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  25.29 
 
 		 555 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.74 
 
 		 538 aa  92.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  26.73 
 
 		 564 aa  92  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  28.07 
 
 		 562 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  25.05 
 
 		 561 aa  90.9  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  28.07 
 
 		 562 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  26.59 
 
 		 562 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.6 
 
 		 557 aa  90.1  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  26.81 
 
 		 565 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.84 
 
 		 554 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  23.55 
 
 		 585 aa  88.6  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.42 
 
 		 581 aa  88.6  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.42 
 
 		 581 aa  88.6  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.69 
 
 		 548 aa  88.2  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  23.2 
 
 		 562 aa  87.4  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.2 
 
 		 562 aa  87.4  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.77 
 
 		 573 aa  87  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  26.87 
 
 		 587 aa  87  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.83 
 
 		 538 aa  87  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.9 
 
 		 584 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.9 
 
 		 639 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0771  polypeptide-transport-associated domain protein, ShlB-type  31.02 
 
 		 310 aa  85.9  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.891277 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.72 
 
 		 560 aa  85.9  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.23 
 
 		 569 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>